73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0339 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0339  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  211  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137634  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2113  protein-export membrane protein  80.36 
 
 		 112 aa  176  8e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1783  protein-export membrane protein  72.34 
 
 		 109 aa  143  7.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0362  preprotein translocase, SecG subunit  63.89 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00086989  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1507  preprotein translocase subunit SecG  62.26 
 
 		 114 aa  129  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2278  preprotein translocase, SecG subunit  65.91 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0286  preprotein translocase subunit SecG  62.39 
 
 		 123 aa  120  9e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0260  preprotein translocase subunit SecG  61.54 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  63.64 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0233  preprotein translocase subunit SecG  59.48 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  32.14 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  29.1 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  36.99 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  36.99 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  32.65 
 
 		 117 aa  50.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0876  preprotein translocase, SecG subunit  38.81 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000204558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  34.94 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  27.55 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  31.13 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  31.86 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  40.28 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  31.33 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  28.23 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  27.42 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2339  preprotein translocase subunit SecG  28.44 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000342289  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  41.18 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  27.62 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1881  preprotein translocase subunit SecG  30 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  28.95 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  29.03 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  34.25 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  28.95 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  30.34 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  27.78 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  28.43 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  28.43 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  27.52 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  44.12 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 77 aa  42  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  23.64 
 
 		 110 aa  42  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  37.33 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  28.83 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  34.15 
 
 		 122 aa  42  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  29.41 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  36.99 
 
 		 125 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1411  preprotein translocase subunit SecG  37.33 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  42.86 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  36 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0718  preprotein translocase subunit SecG  34.55 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.106804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  37.14 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  37.14 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  37.14 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  23.81 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1696  preprotein translocase subunit SecG  40.28 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000318284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  23.81 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  37.68 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>