111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0362 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0362  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 
109 aa  215  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00086989  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2113  protein-export membrane protein  67.62 
 
 
112 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0339  AraC family transcriptional regulator  63.89 
 
 
109 aa  138  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137634  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1783  protein-export membrane protein  62.37 
 
 
109 aa  118  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2278  preprotein translocase, SecG subunit  63.53 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1507  preprotein translocase subunit SecG  53.77 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0286  preprotein translocase subunit SecG  60.38 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0260  preprotein translocase subunit SecG  60.38 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  61.18 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0233  preprotein translocase subunit SecG  60.38 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  40 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  34.23 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  37.38 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  37.38 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  32.08 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  37.65 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  30.84 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  35.29 
 
 
117 aa  51.2  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  42.05 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  40.91 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2339  preprotein translocase subunit SecG  34.12 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000342289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  29.82 
 
 
126 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  31.63 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1881  preprotein translocase subunit SecG  34.88 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  39.47 
 
 
114 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  32.94 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  30.61 
 
 
125 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  29.09 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  40.24 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  40.24 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  28.57 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  40.24 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  40.24 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  40.24 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  40.24 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  40.24 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  39.53 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  40.24 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  40.85 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  39.51 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  41.33 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  41.77 
 
 
125 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  41.77 
 
 
125 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  49.21 
 
 
77 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  39.51 
 
 
125 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1892  preprotein translocase subunit SecG  43.02 
 
 
120 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0659657  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  40.51 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  40.51 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1411  preprotein translocase subunit SecG  41.18 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402917  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  40.51 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  32.35 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  32.91 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  29.41 
 
 
203 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  26.85 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2215  preprotein translocase subunit SecG  44.29 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  42.25 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  26.85 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  31.11 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  25 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  28.44 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  41.89 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  44.12 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4580  preprotein translocase subunit SecG  32.89 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452922  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  25 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4715  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0498  preprotein translocase, SecG subunit  29.09 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0960  preprotein translocase subunit SecG  42.65 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514774  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  31.65 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  34.21 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  39.19 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  30.63 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  30.63 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0876  preprotein translocase, SecG subunit  37.5 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000204558  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  34.09 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1766  preprotein translocase subunit SecG  31.4 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  30.95 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0718  preprotein translocase subunit SecG  29.89 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.106804 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0820  preprotein translocase, SecG subunit  41.03 
 
 
114 aa  42.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  40.54 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  30.38 
 
 
102 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  37.84 
 
 
77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  37.84 
 
 
77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  28.3 
 
 
111 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  29.76 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  28.3 
 
 
111 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  28.3 
 
 
111 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  38.57 
 
 
116 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  30.38 
 
 
102 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  29.36 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  29.36 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>