180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0776 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 127 aa  247  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  84.25 
 
 		 126 aa  201  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  83.46 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  78.57 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  71.2 
 
 		 129 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0718  preprotein translocase subunit SecG  80.77 
 
 		 130 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.106804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4580  preprotein translocase subunit SecG  78.03 
 
 		 132 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  70.54 
 
 		 129 aa  166  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  69.77 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4715  preprotein translocase subunit SecG  77.27 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  51.67 
 
 		 111 aa  103  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  42.64 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  54.05 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  53.21 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  46.28 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  46.77 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  45 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  41.98 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  47.11 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  47.79 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  49.5 
 
 		 98 aa  92.8  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  49.5 
 
 		 98 aa  92.8  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  58.97 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  43.75 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  48.21 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  48.65 
 
 		 110 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  46.72 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  46.72 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  46.72 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  46.72 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  46.72 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  46.72 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  46.72 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  46.72 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  47.12 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  45.9 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  45.9 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  43.7 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  44.26 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  61.64 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  45.9 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  45.9 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  45.9 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  43.7 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  47.66 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  45.08 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  42.98 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  46.6 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  46.22 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  41.94 
 
 		 111 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  46.22 
 
 		 111 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  46.22 
 
 		 111 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  46.22 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1024  preprotein translocase, SecG subunit  47.54 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00245496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  46.9 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  55.84 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  46.36 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  58.44 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  38.64 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  53.85 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  51.32 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  53.85 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  53.85 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  53.85 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  53.85 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  51.9 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  53.85 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  53.85 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  53.85 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  51.32 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  54.43 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  53.33 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  51.9 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  51.9 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  53.85 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  51.9 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  51.9 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  59.72 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  61.11 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  50.63 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  50.63 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  51.28 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  60.66 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1892  preprotein translocase subunit SecG  53.85 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0659657  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  45.05 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  45.05 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  43.93 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2215  preprotein translocase subunit SecG  52.56 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  52.78 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0960  preprotein translocase subunit SecG  51.28 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514774  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2063  preprotein translocase subunit SecG  59.09 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0208548  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  41 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  47.3 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1201  preprotein translocase subunit SecG  44.34 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  36.79 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1023  preprotein translocase subunit SecG  57.81 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000127153  hitchhiker  0.000118178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1027  preprotein translocase subunit SecG  57.81 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000711924  hitchhiker  0.0000365596 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  36.79 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>