53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1783 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1783  protein-export membrane protein  100 
 
 		 109 aa  211  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0339  AraC family transcriptional regulator  69.72 
 
 		 109 aa  159  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137634  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2113  protein-export membrane protein  59.46 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1507  preprotein translocase subunit SecG  59.46 
 
 		 114 aa  127  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0362  preprotein translocase, SecG subunit  57.01 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00086989  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2278  preprotein translocase, SecG subunit  63.74 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  59.05 
 
 		 133 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0286  preprotein translocase subunit SecG  55.08 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0260  preprotein translocase subunit SecG  54.24 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0233  preprotein translocase subunit SecG  54.7 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  37.5 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  37.5 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  31.53 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0876  preprotein translocase, SecG subunit  37.5 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000204558  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  30.63 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  28.87 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  31 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  30.36 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  30.36 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  28.57 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  37.8 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  25.96 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  42.25 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  29.13 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1411  preprotein translocase subunit SecG  31.03 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  29.13 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  32 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  34.12 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  30.91 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  30.91 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  30.91 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  27.03 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  30.91 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  30.91 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  30.91 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1503  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000422851  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1293  preprotein translocase subunit SecG  34.25 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000521204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  30.91 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  30.91 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  30.91 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  30.91 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  30.91 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  30.91 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  30.91 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  28.3 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  28.16 
 
 		 111 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  36.11 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  36.11 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  32.29 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  27.03 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  35.44 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  31.25 
 
 		 114 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>