28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1293 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1503  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 76 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000422851  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1293  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 76 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000521204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  35.82 
 
 		 79 aa  57  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2867  preprotein translocase, SecG subunit  31.08 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2253  preprotein translocase, SecG subunit  39.29 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0144  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000227972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  38.46 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  30.26 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  31.43 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  31.58 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  28.95 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  31.51 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  31.51 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  28.77 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0392  preprotein translocase, SecG subunit  39.19 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852379  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1783  protein-export membrane protein  34.25 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  26.32 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>