26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0172 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0172  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
110 aa  216  7e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0115  preprotein translocase subunit SecG  92.73 
 
 
110 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0467  preprotein translocase subunit SecG  47.66 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  31.13 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  28.44 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  29.9 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  29.9 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  29.9 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  29.9 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  29.9 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  29.9 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  29.9 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  29.9 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  36.71 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  29.9 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  29.9 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  26.53 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  30.77 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  29.9 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  29.9 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  29.9 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  36.9 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0822  preprotein translocase subunit SecG  30 
 
 
118 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264416  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  35.94 
 
 
110 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  35.44 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  26.79 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>