120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1171 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1171  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 154 aa  286  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.302902 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2018  protein translocase subunit secG  73.56 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.906411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  69.05 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  46.91 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1635  preprotein translocase subunit SecG  39.22 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  31.25 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  28.8 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  29.46 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  29.6 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  38.46 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  42.67 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  30.4 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  30.4 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  30.4 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  30.4 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  30.4 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  29.6 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  43.24 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  31.53 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  29.46 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  29.6 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  29.6 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  31.17 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  34.45 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  26.85 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  39.19 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  28.8 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  28.8 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  28.8 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  28.8 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  28.8 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  30.89 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  29.52 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  26.4 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  30.89 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2472  preprotein translocase subunit SecG  42.7 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.259492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  30.19 
 
 		 112 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2052  preprotein translocase subunit SecG  44.87 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  30.56 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4199  preprotein translocase, SecG subunit  45.12 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  26.17 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  30.56 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  30.56 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3232  preprotein translocase subunit SecG  47.44 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1407  protein translocase subunit secG  47.19 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.014821  hitchhiker  0.0000286367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  26.17 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  26.17 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3157  preprotein translocase, SecG subunit  39.37 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337496  normal  0.0463727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2766  preprotein translocase, SecG subunit  42.31 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  35.14 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  26.17 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  35.62 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  36.76 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1096  preprotein translocase subunit SecG  43.84 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  43.84 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  43.84 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  36.26 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  34.57 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  35.14 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_004310  BR1137  preprotein translocase subunit SecG  42.47 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5569  preprotein translocase, SecG subunit  44.44 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2825  preprotein translocase subunit SecG  42.17 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  31.08 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4477  preprotein translocase subunit SecG  40.86 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  36.71 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  42.47 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5401  preprotein translocase, SecG subunit  43.06 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0268  preprotein translocase subunit SecG  38.55 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1888  protein translocase subunit secG  39.2 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.073496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  33.78 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0874  preprotein translocase subunit SecG  46.05 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0239  preprotein translocase subunit SecG  37.35 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  31.08 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  29.01 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  31.08 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01286  preprotein translocase subunit SecG  34.11 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.582279  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2832  preprotein translocase subunit SecG  40.26 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2113  protein-export membrane protein  29.66 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  43.84 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0367  preprotein translocase subunit SecG  44.74 
 
 		 208 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1834  preprotein translocase subunit SecG  45.57 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  32.61 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  39.39 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  39.39 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  28.97 
 
 		 111 aa  44.3  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  43.04 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1892  preprotein translocase subunit SecG  40.91 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0659657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1833  preprotein translocase subunit SecG  44.12 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352461  hitchhiker  0.00941444 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  39.44 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2030  preprotein translocase subunit SecG  50 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.887761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  39.34 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  37.88 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2215  preprotein translocase subunit SecG  40.91 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2063  preprotein translocase subunit SecG  39.39 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0208548  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  37.88 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  37.88 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  37.7 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>