74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0874 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0874  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 207 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0367  preprotein translocase subunit SecG  90 
 
 		 208 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2011  preprotein translocase subunit SecG  89.17 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2743  preprotein translocase subunit SecG  63.2 
 
 		 122 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0128436 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3712  preprotein translocase subunit SecG  50.49 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3180  preprotein translocase subunit SecG  58.54 
 
 		 123 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.908112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1635  preprotein translocase subunit SecG  42.86 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  51.04 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  51.04 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  46.25 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2052  preprotein translocase subunit SecG  48.94 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  48.11 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  51.76 
 
 		 140 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1096  preprotein translocase subunit SecG  48.08 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4477  preprotein translocase subunit SecG  50 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  52.17 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_004310  BR1137  preprotein translocase subunit SecG  47.12 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4199  preprotein translocase, SecG subunit  44.44 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3232  preprotein translocase subunit SecG  48.11 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5569  preprotein translocase, SecG subunit  50.65 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2030  preprotein translocase subunit SecG  44.44 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.887761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1888  protein translocase subunit secG  40.46 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.073496  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1833  preprotein translocase subunit SecG  48.19 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352461  hitchhiker  0.00941444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1451  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  29.41 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5401  preprotein translocase, SecG subunit  53.42 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  45.9 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  37.18 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  37.18 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  31.76 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 107 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2825  preprotein translocase subunit SecG  47.22 
 
 		 128 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2472  preprotein translocase subunit SecG  48.24 
 
 		 128 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.259492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  48.15 
 
 		 130 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.28 
 
 		 2449 aa  52  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  37.21 
 
 		 106 aa  52  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2766  preprotein translocase, SecG subunit  49.38 
 
 		 169 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  34.29 
 
 		 124 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3157  preprotein translocase, SecG subunit  42.65 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337496  normal  0.0463727 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1407  protein translocase subunit secG  52.38 
 
 		 112 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.014821  hitchhiker  0.0000286367 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  36.36 
 
 		 98 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1834  preprotein translocase subunit SecG  47.62 
 
 		 124 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  36.36 
 
 		 98 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  38.57 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  29.1 
 
 		 126 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1171  preprotein translocase, SecG subunit  44.87 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.302902 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  38.38 
 
 		 118 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  30.87 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  31.63 
 
 		 111 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  35.71 
 
 		 133 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  35.71 
 
 		 133 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  36.9 
 
 		 114 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  34.29 
 
 		 114 aa  45.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  32.26 
 
 		 111 aa  44.7  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1024  preprotein translocase, SecG subunit  31.71 
 
 		 117 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00245496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  31.18 
 
 		 111 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  30.38 
 
 		 126 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  30.38 
 
 		 126 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  34.29 
 
 		 111 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  31.18 
 
 		 111 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  35.37 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  35.37 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  35.37 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  35.37 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  31.18 
 
 		 111 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  35.37 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  31.18 
 
 		 111 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  31.33 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1068  preprotein translocase subunit SecG  59.26 
 
 		 156 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2232  protein-export membrane protein SECG  44.32 
 
 		 128 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  29.55 
 
 		 111 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  31.07 
 
 		 102 aa  42.4  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  36.71 
 
 		 112 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  29.46 
 
 		 134 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>