104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3180 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3180  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
123 aa  234  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.908112  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2743  preprotein translocase subunit SecG  62.1 
 
 
122 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0128436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0367  preprotein translocase subunit SecG  53.66 
 
 
208 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0874  preprotein translocase subunit SecG  56.1 
 
 
207 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2011  preprotein translocase subunit SecG  53.66 
 
 
203 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0745159  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3712  preprotein translocase subunit SecG  58.68 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  42.86 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  42.86 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  48.96 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  40.26 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  40.26 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  38.82 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  43.9 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2052  preprotein translocase subunit SecG  46.46 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1635  preprotein translocase subunit SecG  49.43 
 
 
162 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5569  preprotein translocase, SecG subunit  47.06 
 
 
135 aa  57  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  32.23 
 
 
126 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  45.68 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  42.47 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  29.91 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  33.33 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1096  preprotein translocase subunit SecG  45.45 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5401  preprotein translocase, SecG subunit  45.88 
 
 
142 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_004310  BR1137  preprotein translocase subunit SecG  44.44 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1024  preprotein translocase, SecG subunit  35.79 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00245496  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  33.64 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  24.58 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1888  protein translocase subunit secG  41.86 
 
 
146 aa  50.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.073496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2472  preprotein translocase subunit SecG  49.41 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.259492  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  28.44 
 
 
111 aa  50.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  50 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  28.46 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4199  preprotein translocase, SecG subunit  47.67 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1451  preprotein translocase, SecG subunit  43.16 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  43.55 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3232  preprotein translocase subunit SecG  46.43 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  30 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  35.9 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  34.12 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  42.35 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1833  preprotein translocase subunit SecG  41.58 
 
 
179 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352461  hitchhiker  0.00941444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2030  preprotein translocase subunit SecG  41.58 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.887761  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  34.57 
 
 
131 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  28.69 
 
 
126 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 
126 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  32.94 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  30.68 
 
 
114 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  26.47 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  30.56 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  30.56 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  32 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  27.91 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2825  preprotein translocase subunit SecG  49.4 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728147  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  29.79 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  35.71 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  27.62 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4477  preprotein translocase subunit SecG  42.7 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  26.42 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  31.71 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  31.17 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  28.3 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2766  preprotein translocase, SecG subunit  44.71 
 
 
169 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  32.05 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  32.05 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  26.42 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  26.42 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  28.74 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  26.42 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  39.08 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  32.05 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  28.43 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  28.74 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  28.72 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  31.73 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1834  preprotein translocase subunit SecG  45.88 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0172  preprotein translocase subunit SecG  26.42 
 
 
110 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0144  preprotein translocase, SecG subunit  38.67 
 
 
83 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000227972  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  28.57 
 
 
110 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1181  preprotein translocase, SecG subunit  40.91 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1154  preprotein translocase, SecG subunit  28.4 
 
 
97 aa  41.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  27.45 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  34.29 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  34.29 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1407  protein translocase subunit secG  43.52 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.014821  hitchhiker  0.0000286367 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  31 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  28.57 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  30.38 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  30.38 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  30.38 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  30.38 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  30.38 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  30.38 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  30.38 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  30.38 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>