104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3712 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3712  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 176 aa  330  5e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2011  preprotein translocase subunit SecG  61.86 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0874  preprotein translocase subunit SecG  59.48 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0367  preprotein translocase subunit SecG  61.02 
 
 		 208 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3180  preprotein translocase subunit SecG  58.82 
 
 		 123 aa  99  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.908112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2743  preprotein translocase subunit SecG  53.66 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0128436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1635  preprotein translocase subunit SecG  40.25 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2766  preprotein translocase, SecG subunit  51.65 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  48.84 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  48.84 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2052  preprotein translocase subunit SecG  38.93 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  51.76 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  48.72 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  42.4 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  34.65 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  48.39 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  32.43 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  38.82 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1888  protein translocase subunit secG  40.74 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.073496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2472  preprotein translocase subunit SecG  41.18 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.259492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  32.14 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  35.8 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  35.8 
 
 		 129 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1096  preprotein translocase subunit SecG  43.16 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5401  preprotein translocase, SecG subunit  47.62 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  31.43 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  36.47 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5569  preprotein translocase, SecG subunit  45.24 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2030  preprotein translocase subunit SecG  40.74 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.887761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1137  preprotein translocase subunit SecG  42.11 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3157  preprotein translocase, SecG subunit  38.46 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337496  normal  0.0463727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  27.71 
 
 		 123 aa  51.6  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1833  preprotein translocase subunit SecG  40.74 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352461  hitchhiker  0.00941444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2825  preprotein translocase subunit SecG  42.42 
 
 		 128 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  37.23 
 
 		 99 aa  51.2  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  35.42 
 
 		 102 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4477  preprotein translocase subunit SecG  43.21 
 
 		 127 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3232  preprotein translocase subunit SecG  45.68 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  44.44 
 
 		 118 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  37.35 
 
 		 129 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  36.71 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  36.84 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2066  preprotein translocase subunit SecG  32.28 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  43.9 
 
 		 130 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  35.42 
 
 		 102 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4199  preprotein translocase, SecG subunit  43.02 
 
 		 133 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1834  preprotein translocase subunit SecG  45.12 
 
 		 124 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  36.9 
 
 		 116 aa  47.8  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  37.97 
 
 		 128 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  34.57 
 
 		 126 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 107 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 107 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  34.57 
 
 		 126 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  29.41 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1024  preprotein translocase, SecG subunit  32.93 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00245496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1451  preprotein translocase, SecG subunit  43.9 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  36.71 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  33.67 
 
 		 107 aa  45.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  33.77 
 
 		 98 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  33.77 
 
 		 98 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  26.72 
 
 		 111 aa  45.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  30.49 
 
 		 124 aa  45.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2232  protein-export membrane protein SECG  48.81 
 
 		 128 aa  45.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  30.37 
 
 		 3333 aa  44.7  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  32.05 
 
 		 115 aa  44.3  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  36.71 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1988  preprotein translocase subunit SecG  35.05 
 
 		 109 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  34.18 
 
 		 79 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  30.48 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1238  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  30.34 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  35.82 
 
 		 111 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  30.48 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  30.48 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  30.48 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  30.48 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  30.48 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  30.48 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  31.51 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  30.48 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  31.51 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  34.52 
 
 		 114 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  34.57 
 
 		 111 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  27.46 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1965  preprotein translocase, SecG subunit  32.88 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00004377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  30.48 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  35.44 
 
 		 130 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  34.51 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250933 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  30.95 
 
 		 110 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  32.43 
 
 		 111 aa  41.6  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  30.95 
 
 		 110 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  30.95 
 
 		 110 aa  42  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  32.65 
 
 		 125 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  30.95 
 
 		 110 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  32.47 
 
 		 113 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  30.95 
 
 		 110 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  32.1 
 
 		 114 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  33.8 
 
 		 112 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 111 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>