98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1238 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1238  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 116 aa  228  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  37 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  38.2 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  33.65 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  33.65 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  33.65 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  33.65 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  33.65 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  32.69 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  32.69 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  32.69 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  32.69 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  34.38 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  37.33 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  42.42 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  31.73 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  31.73 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  31.73 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  31.73 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  31.73 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  41.79 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  32.67 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  41.79 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  29.59 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  33.66 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  31.25 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  29.59 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0812  preprotein translocase, SecG subunit  36.96 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.184287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  38.16 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  36.84 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  42.03 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  40.3 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  29.81 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  35.35 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  35.21 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  31.03 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  47.62 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  39.39 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  38.67 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  32 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  44.78 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  43.28 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  34.83 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  44.87 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  43.28 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1154  preprotein translocase, SecG subunit  28.41 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  40.51 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0960  preprotein translocase subunit SecG  43.59 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  31.52 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  36.36 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2215  preprotein translocase subunit SecG  45.71 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  31.52 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  37 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1892  preprotein translocase subunit SecG  44.29 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0659657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  37 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  41.03 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  38.1 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1548  preprotein translocase, SecG subunit  25 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.651652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  31.78 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  38.46 
 
 		 116 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  33.01 
 
 		 127 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 160 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  29.25 
 
 		 114 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  39.74 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  39.74 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  36.92 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  40.85 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 		 125 aa  40.8  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  41.79 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  35.94 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  38.46 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  38.46 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  38.46 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  35.94 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  35.94 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  35.94 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  38.46 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  35.94 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  36.84 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  35.94 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  35.94 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  30.84 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  35.94 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>