157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0509 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0509  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 123 aa  238  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1451  preprotein translocase, SecG subunit  69.84 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1834  preprotein translocase subunit SecG  61.82 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1096  preprotein translocase subunit SecG  65.42 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1137  preprotein translocase subunit SecG  64.49 
 
 		 148 aa  103  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4477  preprotein translocase subunit SecG  61.61 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2052  preprotein translocase subunit SecG  63.21 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3232  preprotein translocase subunit SecG  66.07 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2472  preprotein translocase subunit SecG  54.62 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.259492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  56.76 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  56.76 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5569  preprotein translocase, SecG subunit  58.56 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  62.61 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  59.32 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2030  preprotein translocase subunit SecG  61.32 
 
 		 177 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.887761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2825  preprotein translocase subunit SecG  57.69 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1833  preprotein translocase subunit SecG  61.32 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352461  hitchhiker  0.00941444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1635  preprotein translocase subunit SecG  57.55 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5401  preprotein translocase, SecG subunit  58.56 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4199  preprotein translocase, SecG subunit  55.81 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  58.04 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1737  preprotein translocase subunit SecG  60.18 
 
 		 130 aa  84.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  56 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  52.7 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2232  protein-export membrane protein SECG  58.49 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1068  preprotein translocase subunit SecG  51.89 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  52.56 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  36.73 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0529  preprotein translocase subunit SecG  47.83 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  40.59 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  35.94 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  40.59 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  38.1 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  41.46 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  39.08 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  34.95 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  40.24 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  34.38 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  34.02 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  40.74 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  37.36 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  37.14 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1888  protein translocase subunit secG  60.71 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.073496  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  34.02 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3157  preprotein translocase, SecG subunit  48.42 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337496  normal  0.0463727 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  38.27 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  36.05 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  41.33 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  35.11 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  33.01 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  33.96 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  32.71 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0543  protein translocase subunit  40 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2743  preprotein translocase subunit SecG  48.24 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0128436 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1620  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0438601  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1238  preprotein translocase subunit SecG  34.69 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  40.54 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0874  preprotein translocase subunit SecG  45.71 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  36.59 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  31.58 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  35.71 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  33.02 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3180  preprotein translocase subunit SecG  45.98 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.908112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  36.59 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  36.59 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  39.51 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  36.59 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  33.33 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  35.37 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  35.37 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  29.51 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  32.35 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  32.08 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  32.08 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1971  preprotein translocase subunit SecG  43.4 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250933 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  32.08 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  32.35 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  32.35 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  35.58 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2018  protein translocase subunit secG  45.45 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.906411  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3712  preprotein translocase subunit SecG  46.43 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  32.63 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2011  preprotein translocase subunit SecG  48.78 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  31.13 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>