39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2085 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2085  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 120 aa  231  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000374558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1629  preprotein translocase subunit SecG  70.64 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000355121  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0720  preprotein translocase subunit SecG  60.33 
 
 		 114 aa  140  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0931  preprotein translocase subunit SecG  68.33 
 
 		 115 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0822  preprotein translocase subunit SecG  61.9 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1531  preprotein translocase subunit SecG  64.46 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1628  preprotein translocase subunit SecG  62.63 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.732885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  29.57 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  29.57 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  29.57 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  29.57 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  29.57 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1825  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.713592  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  29.57 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  29.57 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  29.57 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  28.7 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  28.7 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  30.17 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  28.7 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  28.7 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  28.7 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  29.57 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  28.7 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  27.83 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  31.03 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  27.83 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  27.83 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  27.83 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  32.82 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  28.7 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5920  preprotein translocase, SecG subunit  29.13 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0413525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0315  preprotein translocase, SecG subunit  33.65 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  27.68 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  31.58 
 
 		 102 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  33.68 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  30.7 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  28.7 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  27.93 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>