49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1531 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1531  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 117 aa  228  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1629  preprotein translocase subunit SecG  71.43 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000355121  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0720  preprotein translocase subunit SecG  63.72 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2085  preprotein translocase subunit SecG  64.46 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000374558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0931  preprotein translocase subunit SecG  70.94 
 
 		 115 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0822  preprotein translocase subunit SecG  62.26 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1628  preprotein translocase subunit SecG  62.07 
 
 		 117 aa  120  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.732885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  32.79 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  35.19 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  31.4 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  34.26 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  33.7 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  28.83 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  28.83 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  28.83 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  28.83 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  28.83 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  28.83 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  28.83 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  28.83 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  28.83 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  28.83 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  28.83 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  28.83 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  28.83 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  31.9 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  30.17 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  31.19 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  29.82 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  29.82 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  31.19 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  28.95 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1928  preprotein translocase, SecG subunit  40.68 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0015663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  33.66 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  33.04 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1825  preprotein translocase subunit SecG  40.98 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.713592  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  33.66 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  33.66 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  28.95 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  30.23 
 
 		 133 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  30.23 
 
 		 133 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  28.95 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  33.66 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  32.35 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  34.88 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0315  preprotein translocase, SecG subunit  30.48 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  34.48 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  28.74 
 
 		 137 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  28.07 
 
 		 110 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>