19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0931 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0931  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
115 aa  218  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966057  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1629  preprotein translocase subunit SecG  73.39 
 
 
119 aa  157  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000355121  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2085  preprotein translocase subunit SecG  68.33 
 
 
120 aa  156  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000374558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0720  preprotein translocase subunit SecG  65.25 
 
 
114 aa  147  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1531  preprotein translocase subunit SecG  70.94 
 
 
117 aa  133  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0822  preprotein translocase subunit SecG  58.47 
 
 
118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264416  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1628  preprotein translocase subunit SecG  62.96 
 
 
117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.732885  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  37.62 
 
 
102 aa  47  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  34.65 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  30.91 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1825  preprotein translocase subunit SecG  39.34 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.713592  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  26.55 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  31.34 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  31.58 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  31.58 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  28.18 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  28.18 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  45.21 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  45.21 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>