50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1628 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1628  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 117 aa  229  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.732885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0822  preprotein translocase subunit SecG  65.81 
 
 		 118 aa  150  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0720  preprotein translocase subunit SecG  64.95 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1629  preprotein translocase subunit SecG  63.27 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000355121  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2085  preprotein translocase subunit SecG  62.63 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000374558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1531  preprotein translocase subunit SecG  62.07 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0931  preprotein translocase subunit SecG  62.96 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0315  preprotein translocase, SecG subunit  40.4 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  33.04 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  30 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  35.45 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1928  preprotein translocase, SecG subunit  37.8 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0015663  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  32.69 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1845  preprotein translocase, SecG subunit  52.83 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  31.37 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1825  preprotein translocase subunit SecG  40.98 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.713592  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  31.68 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  29.66 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  33.04 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  36.11 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  40.43 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  31.82 
 
 		 110 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  28.57 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  32.73 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  32.73 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  32.73 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  35.82 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  35.82 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  32.73 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  32.73 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  30.28 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  30.28 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  32.35 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  30.28 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  30.28 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  30.28 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  38.71 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  33.04 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  34.04 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  32.11 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  32.73 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  31.82 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  31.82 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  31.82 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  32.08 
 
 		 137 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>