14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0720 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0720  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
114 aa  224  4e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1629  preprotein translocase subunit SecG  67.68 
 
 
119 aa  141  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000355121  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0822  preprotein translocase subunit SecG  64.22 
 
 
118 aa  141  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264416  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2085  preprotein translocase subunit SecG  60.33 
 
 
120 aa  140  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000374558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1531  preprotein translocase subunit SecG  63.72 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0931  preprotein translocase subunit SecG  65.25 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966057  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1628  preprotein translocase subunit SecG  64.95 
 
 
117 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.732885  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0315  preprotein translocase, SecG subunit  36.89 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  27.43 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0271  preprotein translocase subunit SecG  36.11 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000402073  normal  0.880463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5920  preprotein translocase, SecG subunit  30.86 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0413525  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  26.42 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1928  preprotein translocase, SecG subunit  38.46 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0015663  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  30.09 
 
 
148 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>