25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3110 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3110  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 528 aa  1008    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2910  fibronectin, type III domain-containing protein  61.48 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.908069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5505  serine/threonine protein kinase  37.58 
 
 		 712 aa  87.4  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5535  serine/threonine protein kinase  46.15 
 
 		 731 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1556  hypothetical protein  42.17 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1596  hypothetical protein  39.76 
 
 		 562 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5425  serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 760 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.026993  normal  0.70686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  30.88 
 
 		 702 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  35.34 
 
 		 829 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  27.91 
 
 		 828 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  33.64 
 
 		 675 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1152  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 590 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.351224  decreased coverage  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.65 
 
 		 1424 aa  50.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  33.09 
 
 		 1056 aa  50.4  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  31.25 
 
 		 2914 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1088 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 1262 aa  47.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  32.31 
 
 		 801 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  25.95 
 
 		 1131 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  34.71 
 
 		 713 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.41 
 
 		 1288 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  32.2 
 
 		 934 aa  43.9  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  34.62 
 
 		 899 aa  43.5  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  26.64 
 
 		 2068 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  32.33 
 
 		 847 aa  43.5  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>