14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1556 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1596  hypothetical protein  73.88 
 
 		 562 aa  718    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1556  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1066    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2910  fibronectin, type III domain-containing protein  44.55 
 
 		 427 aa  90.5  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.908069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3110  fibronectin type III domain-containing protein  40 
 
 		 528 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5505  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 		 712 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  29.53 
 
 		 675 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5535  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 731 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1068 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  24.22 
 
 		 1262 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.31 
 
 		 2449 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 843 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 837 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 		 1088 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  23.19 
 
 		 828 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>