18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2910 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2910  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 427 aa  824    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.908069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3110  fibronectin type III domain-containing protein  62.26 
 
 		 528 aa  257  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5505  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 712 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5535  serine/threonine protein kinase  44.68 
 
 		 731 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1556  hypothetical protein  46.99 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1596  hypothetical protein  44.58 
 
 		 562 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5425  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 760 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.026993  normal  0.70686 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1152  serine/threonine protein kinase  39.74 
 
 		 590 aa  50.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.351224  decreased coverage  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1088 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  30.68 
 
 		 828 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 1283 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 		 1288 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  34.09 
 
 		 2179 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  32.54 
 
 		 702 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  35.24 
 
 		 1056 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 1424 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 829 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.81 
 
 		 1131 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>