More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5425 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5425  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
760 aa  1484    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.026993  normal  0.70686 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1152  serine/threonine protein kinase  35.32 
 
 
590 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.351224  decreased coverage  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1846  serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 
558 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  34.08 
 
 
763 aa  99.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 
646 aa  97.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6706  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 
664 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0848687  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  32.32 
 
 
1110 aa  94  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0642  serine/threonine protein kinase  34.5 
 
 
519 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174048  normal  0.37866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 
776 aa  93.2  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  27.87 
 
 
511 aa  93.2  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 
671 aa  92  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  28.06 
 
 
993 aa  92  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0956  serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 
473 aa  91.7  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1757  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
510 aa  91.7  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0458  serine/threonine protein kinase  35.32 
 
 
605 aa  91.3  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  31.95 
 
 
586 aa  90.5  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  33.16 
 
 
484 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
517 aa  88.6  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  35.47 
 
 
464 aa  88.6  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
349 aa  88.2  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 
612 aa  88.2  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 
1009 aa  87.8  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  27.74 
 
 
1009 aa  87.8  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  27.74 
 
 
1017 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.44 
 
 
591 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  36.1 
 
 
464 aa  87  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.77 
 
 
438 aa  87  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  31.37 
 
 
593 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 
666 aa  86.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3486  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 
989 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00873447  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34440  protein kinase family protein  29.62 
 
 
519 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.919074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1338  serine/threonine protein kinase  28.73 
 
 
602 aa  85.5  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000158737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.56 
 
 
562 aa  85.1  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 
430 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 
430 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.3 
 
 
880 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 
431 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  30.2 
 
 
621 aa  84  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07550  serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
568 aa  84  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0745777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 
613 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21540  serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 
553 aa  82.8  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 
1104 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2211  serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 
475 aa  83.2  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529503  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1394  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 
501 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.860745  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1754  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00149548 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  25 
 
 
634 aa  82.4  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 
503 aa  82  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  33.51 
 
 
522 aa  81.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5535  serine/threonine protein kinase  46.22 
 
 
731 aa  81.6  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193423  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6482  serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 
591 aa  81.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.86 
 
 
614 aa  80.9  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3707  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
480 aa  80.9  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.58 
 
 
650 aa  80.5  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.11 
 
 
499 aa  80.5  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5526  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
576 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.539423 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5928  protein kinase  30.6 
 
 
576 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  30.23 
 
 
574 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2199  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 
522 aa  80.1  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0725678  hitchhiker  0.00985459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  33.07 
 
 
783 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  28.57 
 
 
1053 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05610  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
693 aa  80.5  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.850356  normal  0.365615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  33.16 
 
 
563 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  34.84 
 
 
513 aa  79.7  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.32 
 
 
916 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.39 
 
 
602 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 
468 aa  79.7  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  25.97 
 
 
662 aa  79.7  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  26.71 
 
 
600 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6426  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 
465 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  29.49 
 
 
956 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
444 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1294  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
581 aa  79.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 
618 aa  78.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  28.98 
 
 
604 aa  78.2  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1327  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
536 aa  78.2  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0293261  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
533 aa  78.2  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.71 
 
 
967 aa  77.8  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 
585 aa  77.8  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  29.5 
 
 
951 aa  77.8  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3790  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 
487 aa  77.8  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
632 aa  77.4  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5505  serine/threonine protein kinase  35.76 
 
 
712 aa  77.4  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945108  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2221  serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5188  serine/threonine protein kinase  25.28 
 
 
625 aa  77.4  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 
573 aa  77.4  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1760  serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 
399 aa  77  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
624 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2040  serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 
451 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00475654  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.47 
 
 
584 aa  77.4  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  31 
 
 
444 aa  77  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
624 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  27.68 
 
 
1057 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  27.66 
 
 
668 aa  77  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
624 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
419 aa  76.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  28.68 
 
 
889 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2698  serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
696 aa  76.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.152894 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2110  serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  29.2 
 
 
1032 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>