126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2008 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2008  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2331  hypothetical protein  90.32 
 
 		 279 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000989316  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2259  hypothetical protein  89.96 
 
 		 279 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000651935  normal  0.545232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2450  hypothetical protein  89.61 
 
 		 279 aa  528  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00881658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2307  hypothetical protein  82.12 
 
 		 300 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2620  hypothetical protein  80.29 
 
 		 288 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000591272  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2695  hypothetical protein  82.77 
 
 		 289 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00011236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2579  hypothetical protein  82.02 
 
 		 289 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624438  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1764  hypothetical protein  81.27 
 
 		 289 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0025937  normal  0.0109092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2412  hypothetical protein  77.27 
 
 		 287 aa  441  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00339272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2240  hypothetical protein  74.07 
 
 		 278 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000381376  hitchhiker  0.000876549 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1503  hypothetical protein  72.53 
 
 		 283 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  73.65 
 
 		 278 aa  441  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2386  hypothetical protein  73.36 
 
 		 289 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000122506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2857  hypothetical protein  72.83 
 
 		 278 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000347655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1305  hypothetical protein  73.33 
 
 		 278 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0297196  normal  0.064547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2900  hypothetical protein  64.1 
 
 		 282 aa  371  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01094  hypothetical protein  58.87 
 
 		 283 aa  355  5.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0997289  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  58.24 
 
 		 281 aa  332  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  57.36 
 
 		 283 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2550  hypothetical protein  56.3 
 
 		 283 aa  326  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.446305  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2641  hypothetical protein  58.56 
 
 		 281 aa  317  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  54.44 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  56.54 
 
 		 280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  54.55 
 
 		 279 aa  309  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2003  hypothetical protein  54.79 
 
 		 277 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2852  hypothetical protein  52.45 
 
 		 281 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.972172  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  52.59 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.867164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0989  hypothetical protein  52.11 
 
 		 276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1305  hypothetical protein  53.82 
 
 		 291 aa  296  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3153  hypothetical protein  51.09 
 
 		 280 aa  294  8e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0753442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0291  protein of unknown function DUF692  53.28 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1837  hypothetical protein  55.68 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21580  hypothetical protein  54.92 
 
 		 284 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3094  hypothetical protein  49.25 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1138  hypothetical protein  41.64 
 
 		 367 aa  225  7e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  43.66 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  40 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  40.38 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  39.61 
 
 		 312 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  40.65 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  35.55 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  35.16 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  38.43 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  38.43 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  39.02 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  38.62 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  38.46 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  36.47 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  36.57 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  36.73 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0975  hypothetical protein  38.21 
 
 		 293 aa  178  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0971  hypothetical protein  38.21 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1009  hypothetical protein  38.21 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  36.19 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  36.53 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  39.57 
 
 		 307 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  38.19 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4775  hypothetical protein  35.04 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  36.46 
 
 		 318 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  35.88 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  35.38 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  39.74 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0846  hypothetical protein  36.3 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  39.74 
 
 		 293 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1242  hypothetical protein  37.16 
 
 		 298 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  34.8 
 
 		 316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0587  hypothetical protein  36.4 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642886  normal  0.716102 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  35.77 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2032  hypothetical protein  36.33 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  35.42 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  32.41 
 
 		 308 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  36.82 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  37.25 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0303  hypothetical protein  35.11 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.371477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1723  hypothetical protein  36.48 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20741  hypothetical protein  33.83 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2959  hypothetical protein  35.51 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0652339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  35.6 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3392  hypothetical protein  34.5 
 
 		 300 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3066  hypothetical protein  37.64 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1607  hypothetical protein  35.66 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4647  hypothetical protein  33.08 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  34.98 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0712  hypothetical protein  32.09 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  31.41 
 
 		 292 aa  152  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0732  hypothetical protein  32.09 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4291  hypothetical protein  34.9 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1381  hypothetical protein  31.84 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0499971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1004  hypothetical protein  31.27 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4401  hypothetical protein  34.9 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2190  hypothetical protein  34.67 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  34.66 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  34.19 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  34.19 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_003296  RS02372  hypothetical protein  36.08 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357992  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0944  hypothetical protein  30.08 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  30.62 
 
 		 289 aa  138  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2359  hypothetical protein  34.17 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>