126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2307 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2307  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  626  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2695  hypothetical protein  82.55 
 
 
289 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00011236  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2579  hypothetical protein  81.85 
 
 
289 aa  477  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2620  hypothetical protein  80.36 
 
 
288 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000591272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1764  hypothetical protein  81.48 
 
 
289 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0025937  normal  0.0109092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2008  hypothetical protein  82.12 
 
 
279 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2259  hypothetical protein  82.33 
 
 
279 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000651935  normal  0.545232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2331  hypothetical protein  82.33 
 
 
279 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000989316  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2450  hypothetical protein  82.33 
 
 
279 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00881658  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2386  hypothetical protein  76.38 
 
 
289 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000122506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2857  hypothetical protein  76.34 
 
 
278 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000347655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1503  hypothetical protein  73.82 
 
 
283 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2412  hypothetical protein  73.4 
 
 
287 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00339272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2240  hypothetical protein  70.91 
 
 
278 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000381376  hitchhiker  0.000876549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  72.99 
 
 
278 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1305  hypothetical protein  74.53 
 
 
278 aa  430  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0297196  normal  0.064547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2900  hypothetical protein  66.17 
 
 
282 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01094  hypothetical protein  58.52 
 
 
283 aa  357  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0997289  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2550  hypothetical protein  57.35 
 
 
283 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.446305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  59.77 
 
 
283 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  56.82 
 
 
281 aa  332  4e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2641  hypothetical protein  58.58 
 
 
281 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  56.6 
 
 
280 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  53.85 
 
 
277 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2003  hypothetical protein  54.14 
 
 
277 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0989  hypothetical protein  53.64 
 
 
276 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2852  hypothetical protein  53.18 
 
 
281 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.972172  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  54.58 
 
 
279 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  52.38 
 
 
277 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.867164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1305  hypothetical protein  54.1 
 
 
291 aa  311  9e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3153  hypothetical protein  51.47 
 
 
280 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0753442  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21580  hypothetical protein  55.02 
 
 
284 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1837  hypothetical protein  55.02 
 
 
284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0291  protein of unknown function DUF692  53.53 
 
 
282 aa  296  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3094  hypothetical protein  50.76 
 
 
277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1138  hypothetical protein  41.75 
 
 
367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  39.57 
 
 
301 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  38.67 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  41.57 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  40.23 
 
 
305 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  38.67 
 
 
310 aa  192  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  37.16 
 
 
287 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  36.78 
 
 
287 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  40.39 
 
 
292 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  39.22 
 
 
299 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  37.68 
 
 
279 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  39.22 
 
 
299 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  38.82 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  40 
 
 
319 aa  182  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  39.43 
 
 
299 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  38.82 
 
 
312 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0971  hypothetical protein  38.04 
 
 
293 aa  178  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1009  hypothetical protein  38.04 
 
 
293 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0975  hypothetical protein  37.55 
 
 
293 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4775  hypothetical protein  34.34 
 
 
290 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  37.1 
 
 
307 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  36.96 
 
 
294 aa  175  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  34.6 
 
 
300 aa  175  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0181481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  35.69 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  39.74 
 
 
303 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  39.74 
 
 
293 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  33.2 
 
 
316 aa  168  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  32.31 
 
 
308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0846  hypothetical protein  34.72 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1242  hypothetical protein  34.09 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1723  hypothetical protein  36.02 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  33.83 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  34.3 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2032  hypothetical protein  36.96 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392339  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  33.07 
 
 
290 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  35.83 
 
 
283 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1381  hypothetical protein  33.84 
 
 
295 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0499971  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0587  hypothetical protein  34.52 
 
 
313 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642886  normal  0.716102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  36.32 
 
 
277 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4647  hypothetical protein  32.44 
 
 
298 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  34.2 
 
 
307 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20741  hypothetical protein  33.96 
 
 
292 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3392  hypothetical protein  33.84 
 
 
300 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  33.7 
 
 
292 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  36.32 
 
 
277 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  35.19 
 
 
300 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3066  hypothetical protein  37.74 
 
 
277 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37853  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  34.35 
 
 
276 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1607  hypothetical protein  35.25 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  35.63 
 
 
339 aa  155  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2959  hypothetical protein  33.79 
 
 
298 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0652339  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2190  hypothetical protein  34.77 
 
 
277 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0303  hypothetical protein  33.85 
 
 
296 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.371477 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  31.42 
 
 
289 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  35.11 
 
 
278 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1004  hypothetical protein  28.67 
 
 
290 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863702  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4401  hypothetical protein  33.2 
 
 
288 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4291  hypothetical protein  33.2 
 
 
288 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0712  hypothetical protein  31.68 
 
 
275 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6305  hypothetical protein  32.57 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0732  hypothetical protein  31.66 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0724  hypothetical protein  29.5 
 
 
289 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02372  hypothetical protein  34.29 
 
 
285 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357992  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0944  hypothetical protein  30.5 
 
 
284 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.98615 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>