127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4647 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007961  Nham_4647  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  621  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  69.45 
 
 
307 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0587  hypothetical protein  69.14 
 
 
313 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642886  normal  0.716102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3392  hypothetical protein  63.74 
 
 
300 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1242  hypothetical protein  58.76 
 
 
298 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  59.06 
 
 
308 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  59.56 
 
 
316 aa  329  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  56.49 
 
 
307 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  55.88 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  55.88 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1607  hypothetical protein  59.43 
 
 
320 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  52.65 
 
 
292 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1723  hypothetical protein  56.23 
 
 
283 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0303  hypothetical protein  56.18 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.371477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  48.39 
 
 
300 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1004  hypothetical protein  43.9 
 
 
290 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863702  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  49.63 
 
 
277 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  49.25 
 
 
277 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  49.45 
 
 
278 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2032  hypothetical protein  47.96 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392339  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0944  hypothetical protein  46.42 
 
 
284 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0732  hypothetical protein  45.49 
 
 
275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3066  hypothetical protein  48.53 
 
 
277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37853  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0712  hypothetical protein  44.65 
 
 
275 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  47.25 
 
 
276 aa  241  9e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6305  hypothetical protein  47.08 
 
 
280 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1557  hypothetical protein  42.39 
 
 
286 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.189943  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  42.86 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0846  hypothetical protein  40.21 
 
 
311 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2190  hypothetical protein  45.13 
 
 
277 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  43.23 
 
 
287 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  43.23 
 
 
287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  43.01 
 
 
289 aa  222  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  41.85 
 
 
312 aa  221  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  44.83 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  42.81 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  41.42 
 
 
319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0971  hypothetical protein  42.12 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1009  hypothetical protein  41.76 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  41.85 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  42.91 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  41.83 
 
 
305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0975  hypothetical protein  42.97 
 
 
293 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  41.48 
 
 
299 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  41.48 
 
 
299 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  41.48 
 
 
299 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  43.73 
 
 
301 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  41.43 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  40.45 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  44.03 
 
 
339 aa  212  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  41.88 
 
 
278 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  42.48 
 
 
278 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2688  hypothetical protein  43.13 
 
 
297 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  38.85 
 
 
294 aa  203  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  41.83 
 
 
279 aa  202  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3962  hypothetical protein  40.44 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.019618 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0724  hypothetical protein  37.77 
 
 
289 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  37.92 
 
 
289 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20741  hypothetical protein  34.93 
 
 
292 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2959  hypothetical protein  37.93 
 
 
298 aa  186  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0652339  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0811  hypothetical protein  37.14 
 
 
313 aa  185  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5627  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1381  hypothetical protein  37.89 
 
 
295 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0499971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4775  hypothetical protein  36.8 
 
 
290 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_003296  RS02372  hypothetical protein  39.21 
 
 
285 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357992  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  37.92 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0181481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2359  hypothetical protein  36.71 
 
 
311 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2533  hypothetical protein  37.37 
 
 
309 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0291  protein of unknown function DUF692  40.46 
 
 
282 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4291  hypothetical protein  37.37 
 
 
288 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4401  hypothetical protein  37.37 
 
 
288 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2852  hypothetical protein  34.64 
 
 
281 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.972172  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2857  hypothetical protein  35.74 
 
 
278 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000347655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3153  hypothetical protein  37.55 
 
 
280 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0753442  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1305  hypothetical protein  35.74 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2620  hypothetical protein  34.6 
 
 
288 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000591272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2579  hypothetical protein  34.22 
 
 
289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624438  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1764  hypothetical protein  33.84 
 
 
289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0025937  normal  0.0109092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2240  hypothetical protein  35.74 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000381376  hitchhiker  0.000876549 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2695  hypothetical protein  34.22 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00011236  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  35.71 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  35.21 
 
 
290 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2550  hypothetical protein  35.61 
 
 
283 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.446305  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  36.73 
 
 
277 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2307  hypothetical protein  32.44 
 
 
300 aa  159  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  35.19 
 
 
283 aa  158  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  34.12 
 
 
278 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3094  hypothetical protein  35.63 
 
 
277 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  36.33 
 
 
277 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.867164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1305  hypothetical protein  32.71 
 
 
278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0297196  normal  0.064547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2331  hypothetical protein  33.72 
 
 
279 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000989316  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2386  hypothetical protein  34.1 
 
 
289 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000122506  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1138  hypothetical protein  32.33 
 
 
367 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1503  hypothetical protein  31.94 
 
 
283 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310146  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2008  hypothetical protein  33.08 
 
 
279 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2003  hypothetical protein  33.71 
 
 
277 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  33.21 
 
 
281 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2259  hypothetical protein  33.72 
 
 
279 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000651935  normal  0.545232 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2412  hypothetical protein  32.94 
 
 
287 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00339272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  35.25 
 
 
280 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2450  hypothetical protein  32.95 
 
 
279 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00881658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>