126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3392 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3392  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  616  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  62.5 
 
 		 307 aa  357  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4647  hypothetical protein  63.74 
 
 		 298 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0587  hypothetical protein  59.5 
 
 		 313 aa  351  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642886  normal  0.716102 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  58.89 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0303  hypothetical protein  61.9 
 
 		 296 aa  332  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.371477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1607  hypothetical protein  60.21 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  58.06 
 
 		 316 aa  328  6e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  57.97 
 
 		 303 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1242  hypothetical protein  60 
 
 		 298 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  57.97 
 
 		 293 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  57.4 
 
 		 307 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  55.71 
 
 		 292 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1723  hypothetical protein  57.36 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  53.55 
 
 		 300 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2032  hypothetical protein  52.92 
 
 		 285 aa  279  4e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1004  hypothetical protein  45.69 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  50.55 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6305  hypothetical protein  51.48 
 
 		 280 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  49.06 
 
 		 278 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0712  hypothetical protein  43.56 
 
 		 275 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0944  hypothetical protein  42.97 
 
 		 284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0732  hypothetical protein  43.56 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0846  hypothetical protein  43.12 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  50.39 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  44.24 
 
 		 289 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1557  hypothetical protein  45.68 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.189943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  45.15 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  46.99 
 
 		 277 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  46.62 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3066  hypothetical protein  47.96 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  41.22 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  45.45 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  40.74 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2688  hypothetical protein  46.21 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118004  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  40.53 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  42.05 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  42.7 
 
 		 278 aa  218  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  45.49 
 
 		 278 aa  218  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  43.61 
 
 		 318 aa  218  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2190  hypothetical protein  45.29 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  42.05 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  39.08 
 
 		 299 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  39.43 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  40.88 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  39.43 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  39.43 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3962  hypothetical protein  43.49 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.019618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2959  hypothetical protein  42.46 
 
 		 298 aa  208  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0652339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  40.88 
 
 		 279 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  38.3 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0971  hypothetical protein  39.64 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1009  hypothetical protein  41.76 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0975  hypothetical protein  39.64 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  39.19 
 
 		 303 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  37.91 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  41.51 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02372  hypothetical protein  42.86 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357992  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2359  hypothetical protein  39.93 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0811  hypothetical protein  37.78 
 
 		 313 aa  195  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5627  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0724  hypothetical protein  37.04 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4291  hypothetical protein  41.67 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4401  hypothetical protein  41.67 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  36.67 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2533  hypothetical protein  39.78 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  40.07 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181481 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1381  hypothetical protein  36.26 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0499971  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20741  hypothetical protein  36.13 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0291  protein of unknown function DUF692  43.23 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4775  hypothetical protein  36.73 
 
 		 290 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2550  hypothetical protein  37.79 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.446305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  34.06 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  38.61 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2003  hypothetical protein  38.37 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  38.01 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  36.86 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2852  hypothetical protein  37.59 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.972172  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2240  hypothetical protein  35.63 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000381376  hitchhiker  0.000876549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  36.13 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.867164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0989  hypothetical protein  38.17 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  33.46 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2412  hypothetical protein  32.74 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00339272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000347655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  35.36 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3153  hypothetical protein  33.82 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0753442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1305  hypothetical protein  33.08 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0297196  normal  0.064547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2307  hypothetical protein  33.84 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2008  hypothetical protein  34.5 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2386  hypothetical protein  33.95 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000122506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1305  hypothetical protein  35.45 
 
 		 291 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3094  hypothetical protein  32.21 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01094  hypothetical protein  31.41 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0997289  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2579  hypothetical protein  33.72 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2620  hypothetical protein  34.1 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000591272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1503  hypothetical protein  32.31 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310146  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1764  hypothetical protein  33.72 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0025937  normal  0.0109092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2695  hypothetical protein  33.72 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00011236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2900  hypothetical protein  32.71 
 
 		 282 aa  152  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21580  hypothetical protein  36.09 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>