127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1029 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  96.03 
 
 		 277 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2190  hypothetical protein  72.92 
 
 		 277 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3066  hypothetical protein  72.2 
 
 		 277 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  65.17 
 
 		 278 aa  346  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6305  hypothetical protein  64.04 
 
 		 280 aa  346  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  63.77 
 
 		 276 aa  340  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2032  hypothetical protein  55.19 
 
 		 285 aa  295  5e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4647  hypothetical protein  49.25 
 
 		 298 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  48.16 
 
 		 308 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0587  hypothetical protein  48.13 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642886  normal  0.716102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  46.86 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  47.57 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  46.24 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  46.79 
 
 		 300 aa  231  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3392  hypothetical protein  46.62 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1723  hypothetical protein  45.85 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  45.39 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1242  hypothetical protein  45.42 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  44.2 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  46.04 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  46.04 
 
 		 293 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  42.05 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  45.05 
 
 		 278 aa  221  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  41.29 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0303  hypothetical protein  47.53 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.371477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1557  hypothetical protein  44.98 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.189943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  40.82 
 
 		 310 aa  215  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1004  hypothetical protein  42.96 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1607  hypothetical protein  46.95 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  41.89 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0846  hypothetical protein  40.96 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0732  hypothetical protein  44.57 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0712  hypothetical protein  44.19 
 
 		 275 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  41.85 
 
 		 279 aa  204  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  39.62 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  39.7 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  43.58 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0971  hypothetical protein  40.53 
 
 		 293 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1009  hypothetical protein  40.53 
 
 		 293 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  39.33 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  39.7 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  39.1 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  40.45 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0975  hypothetical protein  40.15 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  40.73 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  39.48 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  39.7 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  43.08 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  38.38 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  41.13 
 
 		 289 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0944  hypothetical protein  39.85 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4775  hypothetical protein  36.86 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  38.2 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  34.93 
 
 		 292 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_003296  RS02372  hypothetical protein  42.01 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357992  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4401  hypothetical protein  40.3 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4291  hypothetical protein  40.3 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  39.71 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  38.77 
 
 		 339 aa  177  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2688  hypothetical protein  43.46 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118004  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1305  hypothetical protein  42.31 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  39.43 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  39.02 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0724  hypothetical protein  37.12 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  39.43 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.867164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2852  hypothetical protein  41.25 
 
 		 281 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.972172  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  36.36 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3153  hypothetical protein  37.21 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0753442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  39.55 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3962  hypothetical protein  36.74 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.019618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2359  hypothetical protein  37.89 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2959  hypothetical protein  41.05 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0652339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2003  hypothetical protein  39.41 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2550  hypothetical protein  37.61 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.446305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0811  hypothetical protein  34.44 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5627  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20741  hypothetical protein  32.97 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2533  hypothetical protein  39.7 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1381  hypothetical protein  33.21 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0499971  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  34.8 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0291  protein of unknown function DUF692  38.11 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0989  hypothetical protein  39.06 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2307  hypothetical protein  36.32 
 
 		 300 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1305  hypothetical protein  34.5 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0297196  normal  0.064547 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2620  hypothetical protein  35.04 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000591272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2857  hypothetical protein  32.58 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000347655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01094  hypothetical protein  32.33 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0997289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21580  hypothetical protein  42.13 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  32.43 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1837  hypothetical protein  40.93 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1764  hypothetical protein  34.19 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0025937  normal  0.0109092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2695  hypothetical protein  34.19 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00011236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2386  hypothetical protein  35.9 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000122506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2579  hypothetical protein  34.19 
 
 		 289 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624438  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  32.21 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1138  hypothetical protein  31.51 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2412  hypothetical protein  32.7 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00339272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2331  hypothetical protein  33.72 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000989316  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2900  hypothetical protein  32.58 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2259  hypothetical protein  33.72 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000651935  normal  0.545232 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>