More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0912 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0912  enolase  100 
 
 
430 aa  853    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0148119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 
430 aa  557  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 
431 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 
431 aa  549  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  62.91 
 
 
431 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 
431 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 
431 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  62.91 
 
 
431 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
427 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  61.94 
 
 
427 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
427 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  62.71 
 
 
431 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  62.71 
 
 
431 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  61.94 
 
 
427 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  61.23 
 
 
427 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
427 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
427 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  61.94 
 
 
427 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 
430 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 
427 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
430 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  64.94 
 
 
429 aa  543  1e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
427 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 
429 aa  544  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  61.23 
 
 
427 aa  541  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 
427 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  60.05 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  63.36 
 
 
424 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  61.41 
 
 
429 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  61.88 
 
 
433 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  61.81 
 
 
425 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 
427 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  65.65 
 
 
426 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  61.23 
 
 
427 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  62.91 
 
 
431 aa  536  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
428 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  61.81 
 
 
425 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  62.91 
 
 
431 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  60.52 
 
 
427 aa  536  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 
427 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  59.91 
 
 
428 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  63.06 
 
 
429 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  61.34 
 
 
425 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  59.1 
 
 
427 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 
427 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  61.18 
 
 
429 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
428 aa  534  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  62.44 
 
 
431 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  59.91 
 
 
428 aa  531  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  62.44 
 
 
431 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  62.56 
 
 
427 aa  532  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  59.63 
 
 
431 aa  533  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  64.08 
 
 
429 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
431 aa  533  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  64.18 
 
 
422 aa  533  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  64.93 
 
 
427 aa  533  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0074  phosphopyruvate hydratase  63.27 
 
 
429 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00475517  unclonable  0.00000000106415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  61.41 
 
 
429 aa  532  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  63.85 
 
 
429 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  61.97 
 
 
427 aa  528  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  64.07 
 
 
428 aa  531  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  64.24 
 
 
429 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  64.65 
 
 
428 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  64.42 
 
 
427 aa  531  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  60.09 
 
 
437 aa  525  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  60.99 
 
 
428 aa  527  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 
429 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  60.86 
 
 
425 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 
429 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  62.88 
 
 
427 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 
426 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  60.47 
 
 
432 aa  527  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 
426 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  63.59 
 
 
427 aa  525  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 
429 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 
429 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  61.32 
 
 
428 aa  524  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  62.05 
 
 
425 aa  522  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
428 aa  524  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  62.05 
 
 
425 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 
427 aa  522  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  60.05 
 
 
427 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2659  phosphopyruvate hydratase  60.62 
 
 
437 aa  521  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  60.05 
 
 
425 aa  522  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  63.51 
 
 
434 aa  524  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  63.12 
 
 
426 aa  523  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  63.79 
 
 
425 aa  522  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  59.86 
 
 
437 aa  521  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  61.94 
 
 
428 aa  523  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2015  enolase  60.76 
 
 
427 aa  521  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000117332  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0278  phosphopyruvate hydratase  59.63 
 
 
437 aa  520  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1018  enolase  64.02 
 
 
426 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.700968  normal  0.0153402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>