31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0532 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  737    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  44.8 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  39.67 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  36.8 
 
 		 376 aa  239  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  34.99 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  32.87 
 
 		 353 aa  192  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2640  hypothetical protein  34.8 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3965  hypothetical protein  33.86 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00271264  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  25.28 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  27.63 
 
 		 323 aa  96.7  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  24.48 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  25 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  26.39 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  25.21 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  25.98 
 
 		 395 aa  86.3  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  25 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17680  hypothetical protein  26.7 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  24.23 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  26.34 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  24.15 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04863  hypothetical protein  25.14 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2941  hypothetical protein  29.92 
 
 		 276 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  22.91 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  23.4 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0076  hypothetical protein  44.44 
 
 		 109 aa  77.4  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2628  hypothetical protein  24.44 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2298  hypothetical protein  26.8 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00541193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2888  hypothetical protein  23.79 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2124  hypothetical protein  25.5 
 
 		 309 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1413  hypothetical protein  26.72 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.675515 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2839  hypothetical protein  24.8 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>