27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04863 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04863  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  822    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  59.5 
 
 
405 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17680  hypothetical protein  61.28 
 
 
404 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  57.25 
 
 
404 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  56.75 
 
 
405 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  57.6 
 
 
381 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  44.3 
 
 
402 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  44.79 
 
 
402 aa  362  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  43.04 
 
 
402 aa  362  9e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  44.79 
 
 
402 aa  359  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  48.17 
 
 
391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  42.57 
 
 
402 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  39.67 
 
 
423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  35.08 
 
 
395 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  26.79 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  22.95 
 
 
392 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  26.27 
 
 
353 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  24.93 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  22.13 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  23.74 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3965  hypothetical protein  26.97 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00271264  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2640  hypothetical protein  22.95 
 
 
339 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2941  hypothetical protein  25.79 
 
 
276 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  23.44 
 
 
323 aa  47  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3241  hypothetical protein  28.7 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2888  hypothetical protein  22.83 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2628  hypothetical protein  22.83 
 
 
279 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>