38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5750 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  811    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  45.26 
 
 		 375 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  38.5 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  35.12 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  32.97 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  32.5 
 
 		 365 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  26.9 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  24.72 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  24.65 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  25.21 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2640  hypothetical protein  28.74 
 
 		 339 aa  116  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  26.34 
 
 		 395 aa  113  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  24.12 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  23.43 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  23.71 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  23.58 
 
 		 423 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  23.12 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  24 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04863  hypothetical protein  22.95 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17680  hypothetical protein  24.65 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  25.34 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3965  hypothetical protein  26.73 
 
 		 332 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00271264  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  25.69 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2628  hypothetical protein  24.92 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2888  hypothetical protein  24.92 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2124  hypothetical protein  22.78 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2941  hypothetical protein  25.98 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0076  hypothetical protein  34.02 
 
 		 109 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  22.56 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4835  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.5 
 
 		 793 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5249  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.5 
 
 		 793 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4877  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.5 
 
 		 793 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5118  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.5 
 
 		 793 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5150  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.5 
 
 		 793 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4734  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase and enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase fusion  32.5 
 
 		 793 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4719  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase and enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase fusion  32.5 
 
 		 793 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5144  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.5 
 
 		 793 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0094  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.91 
 
 		 793 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>