20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0076 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0076  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  223  7e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  44.44 
 
 
375 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  34.02 
 
 
392 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  29.17 
 
 
365 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  35.9 
 
 
354 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  30.77 
 
 
402 aa  54.7  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  29.81 
 
 
402 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  29.7 
 
 
423 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  30.61 
 
 
405 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  29.79 
 
 
381 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  29.79 
 
 
404 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  23.96 
 
 
353 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17680  hypothetical protein  30.69 
 
 
404 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  28.72 
 
 
405 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  27.18 
 
 
402 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  27.55 
 
 
402 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  28.97 
 
 
395 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  27.18 
 
 
402 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  25.77 
 
 
391 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  24.42 
 
 
323 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>