27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3717 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  647    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  33.13 
 
 
354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  26.85 
 
 
365 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  26.52 
 
 
353 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3965  hypothetical protein  29.94 
 
 
332 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00271264  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2640  hypothetical protein  29.85 
 
 
339 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  27.63 
 
 
375 aa  96.7  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  27.56 
 
 
395 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  24.07 
 
 
376 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  25.69 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  25.64 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  26.9 
 
 
402 aa  67  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  26.35 
 
 
402 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  24.92 
 
 
402 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2124  hypothetical protein  26.72 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  28.57 
 
 
423 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  23.4 
 
 
402 aa  56.6  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17680  hypothetical protein  25.09 
 
 
404 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  26.8 
 
 
404 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  25.3 
 
 
405 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04863  hypothetical protein  23.44 
 
 
402 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  25.79 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2888  hypothetical protein  26.47 
 
 
279 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2628  hypothetical protein  24.55 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  21.73 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  25.4 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2941  hypothetical protein  25.65 
 
 
276 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>