23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2888 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2888  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2628  hypothetical protein  91.04 
 
 		 279 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2941  hypothetical protein  54.8 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2124  hypothetical protein  46.72 
 
 		 309 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  24.92 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2640  hypothetical protein  28.63 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  23.99 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  27.76 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  26.1 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  23.79 
 
 		 375 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  24.09 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  25.97 
 
 		 402 aa  53.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  25.69 
 
 		 365 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  21.55 
 
 		 423 aa  52.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  24.62 
 
 		 402 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  23.41 
 
 		 402 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  21.2 
 
 		 402 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  24.71 
 
 		 405 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  26.47 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  24.11 
 
 		 402 aa  45.8  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04863  hypothetical protein  22.83 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  22.92 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  19.6 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>