More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0509 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0509  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0674333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  58.1 
 
 		 104 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  53.33 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  53.7 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  48.57 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  47.62 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  46.3 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  51.92 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  52.63 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  55.56 
 
 		 113 aa  103  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  53.85 
 
 		 102 aa  103  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  51.43 
 
 		 101 aa  103  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  52.08 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  49.09 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  59.77 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  50.48 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  49.07 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  48.11 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  48.21 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  51.02 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  48.11 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  47.12 
 
 		 99 aa  98.2  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  48.57 
 
 		 102 aa  98.2  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  49.06 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  45.28 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  44.55 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  47.06 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  52.75 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  49.5 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  46.3 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  46.3 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  43.1 
 
 		 191 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  42.45 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  43.14 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  46.23 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  43.14 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  47.52 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  50.49 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  47.52 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  49 
 
 		 109 aa  87.4  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  45.71 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  41.28 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1227  hypothetical protein  48.42 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0431183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  46 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  46 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  45 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  44.66 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  44.34 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1671  hypothetical protein  45.54 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  44.12 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  44.21 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  44.44 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  42.45 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  42.45 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  42.72 
 
 		 108 aa  84.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  45.19 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  48.94 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  45 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1190  hypothetical protein  46.32 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0238697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  51.49 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  43.4 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  45.65 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  40.37 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  45 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  47.37 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  38.1 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  43.88 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  43.43 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  38.1 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  51.16 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  42.45 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  43.88 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  40.37 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  38.1 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  43 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  43.16 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  44 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  38 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  44.44 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>