90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1915 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1267  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  92.46 
 
 		 358 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.208012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2609  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  92.46 
 
 		 358 aa  663    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399989  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1915  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  100 
 
 		 358 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.863389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1723  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  79.44 
 
 		 364 aa  567  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621377  normal  0.251189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1865  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  76.06 
 
 		 361 aa  548  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.016186  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0911  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  79.55 
 
 		 359 aa  537  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1781  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  74.01 
 
 		 361 aa  519  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0097  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  61.56 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0218  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  61.17 
 
 		 368 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5250  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  59.78 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4903  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  59.89 
 
 		 377 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0792  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  60.22 
 
 		 368 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0399  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  61.45 
 
 		 363 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0904  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  60.34 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0181  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  58.1 
 
 		 364 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.5734  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0436  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  61.73 
 
 		 371 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0140  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  60.34 
 
 		 368 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.878428  normal  0.626976 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0134  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  58.73 
 
 		 365 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0404  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  60.39 
 
 		 372 aa  411  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0372  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  60.39 
 
 		 372 aa  411  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0410  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  59.5 
 
 		 385 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0191  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  58.77 
 
 		 364 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0836606  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0320  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  58.82 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0306  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  58.82 
 
 		 363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1200  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.31 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.811459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0769  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  60.34 
 
 		 368 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0826496  hitchhiker  0.00227183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0472  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  59.34 
 
 		 375 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0545  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  62.28 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7450  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  60 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6539  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  59.44 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1037  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.34 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2311  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  60.67 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293691  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1017  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.16 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286027 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0492  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.9 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.426416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1662  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  52.39 
 
 		 339 aa  350  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.48 
 
 		 194 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.25 
 
 		 201 aa  54.7  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.49 
 
 		 194 aa  53.9  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.85 
 
 		 191 aa  52.8  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.77 
 
 		 199 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.19 
 
 		 185 aa  51.6  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.49 
 
 		 196 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0327  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.05 
 
 		 184 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 		 193 aa  50.4  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.85 
 
 		 191 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.19 
 
 		 192 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.49 
 
 		 191 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.22 
 
 		 191 aa  49.7  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  27.85 
 
 		 191 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01987  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.71 
 
 		 197 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303345  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.12 
 
 		 200 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.22 
 
 		 180 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.5 
 
 		 195 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.33 
 
 		 194 aa  47  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 		 191 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.1 
 
 		 191 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.25 
 
 		 199 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.85 
 
 		 201 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.05 
 
 		 193 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.79 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1090  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 		 192 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.22 
 
 		 216 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.83 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0207853  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1592  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.83 
 
 		 193 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00335404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.58 
 
 		 179 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.56 
 
 		 196 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.22 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2358  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.83 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1167  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.83 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2205  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.83 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.62 
 
 		 203 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  24.56 
 
 		 182 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.04 
 
 		 191 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.5 
 
 		 193 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.78 
 
 		 185 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.25 
 
 		 196 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0995  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.22 
 
 		 193 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01971  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.22 
 
 		 193 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01960  hypothetical protein  26.22 
 
 		 193 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.88 
 
 		 194 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3002  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.22 
 
 		 193 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.304986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.74 
 
 		 211 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.99 
 
 		 195 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.04 
 
 		 190 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.6 
 
 		 196 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.04 
 
 		 190 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.04 
 
 		 190 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.04 
 
 		 189 aa  43.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1899  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.7 
 
 		 199 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.234563  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.14 
 
 		 191 aa  42.7  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>