83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6539 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6539  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  100 
 
 		 361 aa  718    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7450  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  93.91 
 
 		 361 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0404  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  78.53 
 
 		 372 aa  551  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0372  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  78.53 
 
 		 372 aa  551  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0436  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  78.25 
 
 		 371 aa  544  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2311  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  78.93 
 
 		 374 aa  498  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293691  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0140  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  67.79 
 
 		 368 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.878428  normal  0.626976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0218  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  68.07 
 
 		 368 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0904  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  68.07 
 
 		 388 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0792  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  67.51 
 
 		 368 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5250  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  67.23 
 
 		 368 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4903  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  66.95 
 
 		 377 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0181  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  64.92 
 
 		 364 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.5734  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0191  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  64.92 
 
 		 364 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0836606  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0399  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  66.01 
 
 		 363 aa  454  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0097  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  64.33 
 
 		 361 aa  454  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1200  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  63.87 
 
 		 367 aa  457  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.811459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0134  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  63.87 
 
 		 365 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0320  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  64.46 
 
 		 383 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0472  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  65.65 
 
 		 375 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0306  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  65.17 
 
 		 363 aa  448  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0769  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  67.7 
 
 		 368 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0826496  hitchhiker  0.00227183 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0545  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  64.9 
 
 		 358 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2609  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  60.28 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399989  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1267  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  60.28 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.208012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1915  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  59.44 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.863389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1723  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  59.72 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621377  normal  0.251189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0410  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  60.91 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1781  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  57.18 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153322 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0911  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  58.99 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1037  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  56.89 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0492  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  58.71 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.426416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1865  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.9 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.016186  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1017  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.89 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1662  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.52 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.86 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.79 
 
 		 203 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  26.47 
 
 		 182 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.99 
 
 		 192 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.32 
 
 		 197 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.06 
 
 		 194 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.71 
 
 		 196 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.5 
 
 		 195 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.25 
 
 		 196 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 		 200 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.78 
 
 		 200 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.87 
 
 		 185 aa  50.1  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.73 
 
 		 201 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0327  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.05 
 
 		 184 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.5 
 
 		 194 aa  49.7  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.28 
 
 		 216 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.93 
 
 		 194 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  28.78 
 
 		 191 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.86 
 
 		 196 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.22 
 
 		 194 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.37 
 
 		 193 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.8 
 
 		 191 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.62 
 
 		 193 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.41 
 
 		 199 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.09 
 
 		 191 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.67 
 
 		 211 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.76 
 
 		 193 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.58 
 
 		 194 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.53 
 
 		 191 aa  46.6  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.62 
 
 		 191 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.14 
 
 		 191 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.45 
 
 		 191 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.21 
 
 		 196 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.48 
 
 		 196 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.43 
 
 		 180 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.29 
 
 		 195 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.86 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.86 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2304  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.66 
 
 		 193 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2348  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.66 
 
 		 193 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2355  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.66 
 
 		 193 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  0.430961 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2248  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.66 
 
 		 193 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.86 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.66 
 
 		 193 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.417752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.14 
 
 		 190 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 		 190 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.05 
 
 		 201 aa  43.1  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.9 
 
 		 191 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>