45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0492 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0492  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  100 
 
 
339 aa  681    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.426416  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0140  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  58.66 
 
 
368 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.878428  normal  0.626976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0218  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  58.66 
 
 
368 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0404  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  60.06 
 
 
372 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37704  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0372  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  60.06 
 
 
372 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423524  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5250  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  58.66 
 
 
368 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0436  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  59.78 
 
 
371 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0792  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  58.26 
 
 
368 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4903  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  58.06 
 
 
377 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0904  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  57.78 
 
 
388 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0134  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.22 
 
 
365 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0097  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.4 
 
 
361 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1662  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.99 
 
 
339 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0181  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.32 
 
 
364 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.5734  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0399  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.87 
 
 
363 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0191  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.04 
 
 
364 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0836606  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1781  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.37 
 
 
361 aa  364  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2311  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  63.41 
 
 
374 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293691  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0320  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.12 
 
 
383 aa  362  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1723  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.78 
 
 
364 aa  362  6e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621377  normal  0.251189 
 
 
-
 
NC_004310  BR0306  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.12 
 
 
363 aa  362  6e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0769  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  57.94 
 
 
368 aa  361  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0826496  hitchhiker  0.00227183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1865  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.9 
 
 
361 aa  361  9e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.016186  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1915  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.9 
 
 
358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.863389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0545  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.49 
 
 
358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6539  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  58.71 
 
 
361 aa  355  5e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7450  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  59.27 
 
 
361 aa  355  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1200  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  52.76 
 
 
367 aa  355  5.999999999999999e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.811459  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0472  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.83 
 
 
375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0410  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  53.33 
 
 
385 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332702  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1267  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.24 
 
 
358 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.208012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2609  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.24 
 
 
358 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399989  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1037  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  51.23 
 
 
394 aa  343  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0911  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  53.78 
 
 
359 aa  339  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1017  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  50 
 
 
386 aa  335  9e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286027 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.03 
 
 
203 aa  49.3  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  30.43 
 
 
182 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.03 
 
 
196 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  30 
 
 
199 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.67 
 
 
200 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.66 
 
 
195 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.06 
 
 
179 aa  46.6  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.06 
 
 
180 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.81 
 
 
200 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 
187 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>