81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0545 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0545  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  100 
 
 		 358 aa  722    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0134  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  83.19 
 
 		 365 aa  611  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0181  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  82.02 
 
 		 364 aa  594  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.5734  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0191  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  81.46 
 
 		 364 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0836606  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_004310  BR0306  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  79.49 
 
 		 363 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0320  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  79.49 
 
 		 383 aa  569  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0399  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  78.65 
 
 		 363 aa  565  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0097  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  76.4 
 
 		 361 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1200  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  72.47 
 
 		 367 aa  530  1e-149  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.811459  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0218  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  64.33 
 
 		 368 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0904  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  63.59 
 
 		 388 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0792  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  63.2 
 
 		 368 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5250  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  62.64 
 
 		 368 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0140  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  64.33 
 
 		 368 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.878428  normal  0.626976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4903  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  62.46 
 
 		 377 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0472  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  65.25 
 
 		 375 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0372  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  63.64 
 
 		 372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0404  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  63.64 
 
 		 372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0436  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  63.64 
 
 		 371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0410  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  64.29 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0769  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  63.59 
 
 		 368 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0826496  hitchhiker  0.00227183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7450  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  62.96 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6539  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  64.9 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1267  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  59.22 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.208012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1915  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  62.28 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.863389 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2609  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  59.22 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399989  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1723  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  61.79 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621377  normal  0.251189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2311  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  65.96 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293691  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1865  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.21 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.016186  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0911  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  59.78 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1781  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.77 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1017  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.2 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1037  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.62 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1662  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  51.41 
 
 		 339 aa  358  7e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0492  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.49 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.426416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.45 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  28.39 
 
 		 182 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.19 
 
 		 195 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.48 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.11 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0327  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.32 
 
 		 184 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.38 
 
 		 199 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.48 
 
 		 194 aa  54.3  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  30.38 
 
 		 178 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.34 
 
 		 180 aa  50.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.27 
 
 		 194 aa  50.1  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.47 
 
 		 192 aa  49.7  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01987  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.35 
 
 		 197 aa  49.7  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303345  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.93 
 
 		 179 aa  49.7  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.3 
 
 		 185 aa  49.3  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1592  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.79 
 
 		 193 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00335404  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1167  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.79 
 
 		 193 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.79 
 
 		 193 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2358  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.79 
 
 		 193 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2205  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.79 
 
 		 193 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.94 
 
 		 193 aa  47.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2551  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.83 
 
 		 193 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3194  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.83 
 
 		 193 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.075679  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2452  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.83 
 
 		 193 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.45 
 
 		 187 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.22 
 
 		 193 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0995  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.08 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01971  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.08 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01960  hypothetical protein  29.08 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1577  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.83 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600323 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3002  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.08 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.304986 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.27 
 
 		 194 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.87 
 
 		 171 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.3 
 
 		 196 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.88 
 
 		 200 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.39 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.68 
 
 		 191 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.52 
 
 		 191 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1043  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.61 
 
 		 207 aa  43.5  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000608448  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.43 
 
 		 197 aa  43.5  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.27 
 
 		 193 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0543  dCTP deaminase  28.47 
 
 		 187 aa  43.1  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.14508  normal  0.0728196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.63 
 
 		 191 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.69 
 
 		 172 aa  43.1  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.79 
 
 		 216 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.29 
 
 		 196 aa  42.7  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>