27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1082 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1082  TP901-1 family phage major tail protein  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2473  hypothetical protein  92.65 
 
 		 137 aa  251  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181779  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1137  TP901-1 family phage major tail protein  91.18 
 
 		 137 aa  248  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2170  hypothetical protein  74.45 
 
 		 137 aa  220  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2894  TP901-1 family phage major tail protein  75.18 
 
 		 137 aa  214  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1065  Phage major tail protein, TP901-1  75 
 
 		 137 aa  214  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1639  Phage major tail protein, TP901-1  75.18 
 
 		 137 aa  213  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0911  TP901-1 family phage major tail protein  55.15 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1699  phage major tail protein, TP901-1 family  58.52 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0600382  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1421  phage major tail protein, TP901-1 family  57.78 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.997697  normal  0.225019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3465  Phage major tail protein, TP901-1  54.01 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0406458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4972  TP901-1 family phage major tail protein  56.2 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392569  hitchhiker  0.0000970804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1419  Phage major tail protein, TP901-1  54.01 
 
 		 135 aa  149  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3161  TP901-1 family phage major tail protein  55.47 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0134128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1983  gene transfer agent (GTA) orf  53.28 
 
 		 135 aa  147  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.516459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2109  phage major tail protein, TP901-1 family  53.28 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411275  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0594  hypothetical protein  52.24 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1345  hypothetical protein  53.73 
 
 		 136 aa  147  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00292894  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1174  Phage major tail protein, TP901-1  54.01 
 
 		 135 aa  147  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1425  TP901-1 family phage major tail protein  58.52 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0384204  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0926  TP901-1 family phage major tail protein  52.9 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.419609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1816  Phage major tail protein, TP901-1  52.21 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0067398  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3910  TP901-1 family phage major tail protein  55.07 
 
 		 138 aa  136  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.69911  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1995  Phage major tail protein, TP901-1  39.69 
 
 		 135 aa  95.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0543379  hitchhiker  0.00425281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3125  Phage major tail protein, TP901-1  38.17 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1649  phage major tail protein, TP901-1  30.33 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70666  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0645  gp16  27.97 
 
 		 246 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>