27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3910 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3910  TP901-1 family phage major tail protein  100 
 
 
138 aa  267  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.69911  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0926  TP901-1 family phage major tail protein  58.7 
 
 
138 aa  166  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.419609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1174  Phage major tail protein, TP901-1  57.97 
 
 
135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1419  Phage major tail protein, TP901-1  57.25 
 
 
135 aa  160  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1065  Phage major tail protein, TP901-1  61.31 
 
 
137 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0911  TP901-1 family phage major tail protein  55.47 
 
 
137 aa  158  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.594868 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3161  TP901-1 family phage major tail protein  57.97 
 
 
135 aa  157  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0134128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1816  Phage major tail protein, TP901-1  56.93 
 
 
135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0067398  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3465  Phage major tail protein, TP901-1  54.35 
 
 
135 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0406458  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2109  phage major tail protein, TP901-1 family  54.35 
 
 
135 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411275  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2473  hypothetical protein  55.47 
 
 
137 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181779  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1082  TP901-1 family phage major tail protein  55.07 
 
 
137 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1699  phage major tail protein, TP901-1 family  54.81 
 
 
136 aa  148  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0600382  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1137  TP901-1 family phage major tail protein  54.74 
 
 
137 aa  147  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1421  phage major tail protein, TP901-1 family  54.81 
 
 
136 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.997697  normal  0.225019 
 
 
-
 
NC_004310  BR0594  hypothetical protein  54.01 
 
 
137 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1639  Phage major tail protein, TP901-1  53.62 
 
 
137 aa  147  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1983  gene transfer agent (GTA) orf  52.17 
 
 
135 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.516459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1345  hypothetical protein  54.07 
 
 
136 aa  147  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00292894  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2170  hypothetical protein  51.45 
 
 
137 aa  146  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2894  TP901-1 family phage major tail protein  52.9 
 
 
137 aa  144  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4972  TP901-1 family phage major tail protein  56.52 
 
 
136 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392569  hitchhiker  0.0000970804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1425  TP901-1 family phage major tail protein  54.07 
 
 
136 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0384204  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3125  Phage major tail protein, TP901-1  46.62 
 
 
135 aa  117  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1995  Phage major tail protein, TP901-1  42.86 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0543379  hitchhiker  0.00425281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1649  phage major tail protein, TP901-1  28.03 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70666  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0645  gp16  26.76 
 
 
246 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>