26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1983 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1983  gene transfer agent (GTA) orf  100 
 
 		 135 aa  270  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.516459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3465  Phage major tail protein, TP901-1  91.11 
 
 		 135 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0406458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2109  phage major tail protein, TP901-1 family  88.15 
 
 		 135 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1419  Phage major tail protein, TP901-1  82.22 
 
 		 135 aa  234  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1816  Phage major tail protein, TP901-1  83.33 
 
 		 135 aa  224  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0067398  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1174  Phage major tail protein, TP901-1  80 
 
 		 135 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3161  TP901-1 family phage major tail protein  70.37 
 
 		 135 aa  204  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0134128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0911  TP901-1 family phage major tail protein  65.19 
 
 		 137 aa  183  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1421  phage major tail protein, TP901-1 family  65.67 
 
 		 136 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.997697  normal  0.225019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1345  hypothetical protein  63.64 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00292894  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1699  phage major tail protein, TP901-1 family  64.93 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0600382  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_004310  BR0594  hypothetical protein  60.9 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1425  TP901-1 family phage major tail protein  61.94 
 
 		 136 aa  164  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0384204  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4972  TP901-1 family phage major tail protein  61.03 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392569  hitchhiker  0.0000970804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1639  Phage major tail protein, TP901-1  54.74 
 
 		 137 aa  156  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1065  Phage major tail protein, TP901-1  55.22 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2894  TP901-1 family phage major tail protein  54.07 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1082  TP901-1 family phage major tail protein  53.28 
 
 		 137 aa  147  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2170  hypothetical protein  50.75 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2473  hypothetical protein  52.99 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181779  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1137  TP901-1 family phage major tail protein  52.24 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0926  TP901-1 family phage major tail protein  47.83 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.419609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3910  TP901-1 family phage major tail protein  52.17 
 
 		 138 aa  136  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.69911  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3125  Phage major tail protein, TP901-1  41.35 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1995  Phage major tail protein, TP901-1  36.84 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0543379  hitchhiker  0.00425281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1649  phage major tail protein, TP901-1  28.46 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70666  normal  0.500579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>