26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4972 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4972  TP901-1 family phage major tail protein  100 
 
 
136 aa  262  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392569  hitchhiker  0.0000970804 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1699  phage major tail protein, TP901-1 family  75.37 
 
 
136 aa  207  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0600382  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1421  phage major tail protein, TP901-1 family  75.37 
 
 
136 aa  207  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.997697  normal  0.225019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1425  TP901-1 family phage major tail protein  76.12 
 
 
136 aa  189  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0384204  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1816  Phage major tail protein, TP901-1  68.15 
 
 
135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0067398  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1419  Phage major tail protein, TP901-1  63.97 
 
 
135 aa  179  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1174  Phage major tail protein, TP901-1  63.97 
 
 
135 aa  177  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2109  phage major tail protein, TP901-1 family  63.24 
 
 
135 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1983  gene transfer agent (GTA) orf  63.24 
 
 
135 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.516459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3465  Phage major tail protein, TP901-1  61.76 
 
 
135 aa  173  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0406458  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3161  TP901-1 family phage major tail protein  61.03 
 
 
135 aa  169  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0134128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1065  Phage major tail protein, TP901-1  60.29 
 
 
137 aa  166  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0911  TP901-1 family phage major tail protein  59.56 
 
 
137 aa  166  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.594868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1345  hypothetical protein  58.65 
 
 
136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00292894  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1082  TP901-1 family phage major tail protein  57.66 
 
 
137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_004310  BR0594  hypothetical protein  55.64 
 
 
137 aa  160  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1639  Phage major tail protein, TP901-1  54.74 
 
 
137 aa  160  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2894  TP901-1 family phage major tail protein  58.09 
 
 
137 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2170  hypothetical protein  54.01 
 
 
137 aa  158  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2473  hypothetical protein  57.35 
 
 
137 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181779  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1137  TP901-1 family phage major tail protein  57.35 
 
 
137 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3910  TP901-1 family phage major tail protein  58.7 
 
 
138 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.69911  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0926  TP901-1 family phage major tail protein  53.62 
 
 
138 aa  146  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.419609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1995  Phage major tail protein, TP901-1  37.59 
 
 
135 aa  94.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0543379  hitchhiker  0.00425281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3125  Phage major tail protein, TP901-1  38.24 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1649  phage major tail protein, TP901-1  24.62 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70666  normal  0.500579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>