26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1639 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1639  Phage major tail protein, TP901-1  100 
 
 
137 aa  274  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1065  Phage major tail protein, TP901-1  75.56 
 
 
137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2473  hypothetical protein  77.78 
 
 
137 aa  216  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181779  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1082  TP901-1 family phage major tail protein  75.18 
 
 
137 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1137  TP901-1 family phage major tail protein  76.3 
 
 
137 aa  213  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2170  hypothetical protein  70.8 
 
 
137 aa  210  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2894  TP901-1 family phage major tail protein  73.13 
 
 
137 aa  207  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0911  TP901-1 family phage major tail protein  60.45 
 
 
137 aa  173  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.594868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1419  Phage major tail protein, TP901-1  59.85 
 
 
135 aa  170  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1421  phage major tail protein, TP901-1 family  60.45 
 
 
136 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.997697  normal  0.225019 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1174  Phage major tail protein, TP901-1  59.85 
 
 
135 aa  166  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1699  phage major tail protein, TP901-1 family  58.96 
 
 
136 aa  166  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0600382  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_004310  BR0594  hypothetical protein  57.46 
 
 
137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1816  Phage major tail protein, TP901-1  56.3 
 
 
135 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0067398  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3465  Phage major tail protein, TP901-1  54.74 
 
 
135 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0406458  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1983  gene transfer agent (GTA) orf  54.74 
 
 
135 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.516459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1425  TP901-1 family phage major tail protein  58.96 
 
 
136 aa  155  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0384204  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2109  phage major tail protein, TP901-1 family  55.47 
 
 
135 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3161  TP901-1 family phage major tail protein  55.47 
 
 
135 aa  153  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0134128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0926  TP901-1 family phage major tail protein  50 
 
 
138 aa  147  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.419609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4972  TP901-1 family phage major tail protein  52.55 
 
 
136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392569  hitchhiker  0.0000970804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1345  hypothetical protein  51.49 
 
 
136 aa  143  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00292894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3910  TP901-1 family phage major tail protein  53.62 
 
 
138 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.69911  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1995  Phage major tail protein, TP901-1  41.35 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0543379  hitchhiker  0.00425281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3125  Phage major tail protein, TP901-1  37.59 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1649  phage major tail protein, TP901-1  33.06 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70666  normal  0.500579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>