28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1425 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1425  TP901-1 family phage major tail protein  100 
 
 		 136 aa  264  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0384204  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1699  phage major tail protein, TP901-1 family  99.26 
 
 		 136 aa  263  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0600382  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1421  phage major tail protein, TP901-1 family  97.06 
 
 		 136 aa  259  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.997697  normal  0.225019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4972  TP901-1 family phage major tail protein  76.12 
 
 		 136 aa  187  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392569  hitchhiker  0.0000970804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1419  Phage major tail protein, TP901-1  66.92 
 
 		 135 aa  184  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1816  Phage major tail protein, TP901-1  65.44 
 
 		 135 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0067398  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1174  Phage major tail protein, TP901-1  66.92 
 
 		 135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0911  TP901-1 family phage major tail protein  62.04 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1983  gene transfer agent (GTA) orf  64.18 
 
 		 135 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.516459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3161  TP901-1 family phage major tail protein  62.69 
 
 		 135 aa  173  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0134128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3465  Phage major tail protein, TP901-1  61.94 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0406458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1065  Phage major tail protein, TP901-1  60.58 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1345  hypothetical protein  59.4 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00292894  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2109  phage major tail protein, TP901-1 family  60.9 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411275  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0594  hypothetical protein  59.56 
 
 		 137 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1639  Phage major tail protein, TP901-1  58.96 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2894  TP901-1 family phage major tail protein  60.45 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2473  hypothetical protein  59.7 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181779  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1137  TP901-1 family phage major tail protein  59.7 
 
 		 137 aa  160  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2170  hypothetical protein  53.73 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1082  TP901-1 family phage major tail protein  58.52 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0926  TP901-1 family phage major tail protein  54.07 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.419609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3910  TP901-1 family phage major tail protein  54.81 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.69911  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3125  Phage major tail protein, TP901-1  36.76 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1995  Phage major tail protein, TP901-1  37.59 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0543379  hitchhiker  0.00425281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1649  phage major tail protein, TP901-1  28.57 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70666  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4290  hypothetical protein  26.95 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6568  hypothetical protein  33.59 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>