21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1649 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1649  phage major tail protein, TP901-1  100 
 
 		 136 aa  277  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70666  normal  0.500579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1419  Phage major tail protein, TP901-1  33.08 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1816  Phage major tail protein, TP901-1  30.08 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0067398  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1174  Phage major tail protein, TP901-1  30.77 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1421  phage major tail protein, TP901-1 family  29.32 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.997697  normal  0.225019 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1699  phage major tail protein, TP901-1 family  28.57 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0600382  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0911  TP901-1 family phage major tail protein  26.4 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1639  Phage major tail protein, TP901-1  33.06 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2894  TP901-1 family phage major tail protein  31.58 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3465  Phage major tail protein, TP901-1  26.92 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0406458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1983  gene transfer agent (GTA) orf  28.46 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.516459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2109  phage major tail protein, TP901-1 family  28.24 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411275  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1065  Phage major tail protein, TP901-1  29.84 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1345  hypothetical protein  29.23 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00292894  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2473  hypothetical protein  31.15 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181779  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1137  TP901-1 family phage major tail protein  30.33 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1082  TP901-1 family phage major tail protein  30.33 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3910  TP901-1 family phage major tail protein  28.03 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.69911  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2170  hypothetical protein  28.69 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1425  TP901-1 family phage major tail protein  27.27 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0384204  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4972  TP901-1 family phage major tail protein  24.3 
 
 		 136 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392569  hitchhiker  0.0000970804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>