26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3125 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3125  Phage major tail protein, TP901-1  100 
 
 		 135 aa  269  8.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1995  Phage major tail protein, TP901-1  73.48 
 
 		 135 aa  203  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0543379  hitchhiker  0.00425281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3910  TP901-1 family phage major tail protein  46.62 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.69911  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3465  Phage major tail protein, TP901-1  41.91 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0406458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1345  hypothetical protein  40.3 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00292894  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1983  gene transfer agent (GTA) orf  41.35 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.516459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2109  phage major tail protein, TP901-1 family  39.85 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411275  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0926  TP901-1 family phage major tail protein  37.4 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.419609 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1419  Phage major tail protein, TP901-1  39.85 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1065  Phage major tail protein, TP901-1  39.1 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1639  Phage major tail protein, TP901-1  37.59 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2170  hypothetical protein  36.84 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1174  Phage major tail protein, TP901-1  39.1 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1082  TP901-1 family phage major tail protein  38.17 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0911  TP901-1 family phage major tail protein  37.5 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594868 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3161  TP901-1 family phage major tail protein  37.5 
 
 		 135 aa  90.1  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0134128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1816  Phage major tail protein, TP901-1  38.35 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0067398  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2894  TP901-1 family phage major tail protein  35.82 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1699  phage major tail protein, TP901-1 family  36.76 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0600382  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1421  phage major tail protein, TP901-1 family  37.4 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.997697  normal  0.225019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2473  hypothetical protein  36.64 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181779  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0594  hypothetical protein  35.56 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1137  TP901-1 family phage major tail protein  35.88 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4972  TP901-1 family phage major tail protein  36.03 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392569  hitchhiker  0.0000970804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1425  TP901-1 family phage major tail protein  34.56 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0384204  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_002978  WD0078  hypothetical protein  33.07 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.680133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>