53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2987 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2987  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  754    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4212  putative citrate utilization protein B (citB)  46.15 
 
 		 372 aa  299  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8555  CitB domain protein  45.99 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.388597  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2322  citrate utilization protein B  48.6 
 
 		 376 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2382  CitB domain protein  47.81 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3552  CitB domain-containing protein  45 
 
 		 370 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1892  citrate utilization protein B  48.89 
 
 		 372 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.494216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5625  CitB domain protein  42.74 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6302  CitB domain-containing protein  41.92 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5879  CitB domain-containing protein  42.46 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2503  putative ferredoxin  44.04 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3176  citrate utilization protein B  48.98 
 
 		 379 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3134  CitB domain protein  42.45 
 
 		 408 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.870392  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6016  CitB domain-containing protein  43.47 
 
 		 404 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.66746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.54 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6133  CitB domain-containing protein  42.46 
 
 		 368 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2723  CitB domain-containing protein  44.13 
 
 		 372 aa  259  7e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4211  Citrate utilization protein B  42.5 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2275  CitB domain-containing protein  43.99 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3416  CitB domain protein  41.33 
 
 		 408 aa  252  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4071  CitB domain-containing protein  41.6 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0749  citrate utilization protein B  43.13 
 
 		 379 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.762495 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0737  citrate utilization protein B  43.13 
 
 		 379 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0797  citrate utilization protein B  43.13 
 
 		 379 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3857  CitB domain-containing protein  39.68 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000315554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0846  citrate utilization protein B  42.86 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0810  citrate utilization protein B  42.86 
 
 		 379 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.972731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2087  CitB domain-containing protein  41.3 
 
 		 389 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0934488  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0640  citrate utilization protein B  44.15 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3814  CitB domain-containing protein  41 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0793  CitB domain-containing protein  42.37 
 
 		 403 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3489  citrate utilization protein B  39.78 
 
 		 388 aa  216  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0620  citrate utilization protein B  40.06 
 
 		 388 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  22.61 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3639  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  31 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820206 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.05 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  23.21 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  26.09 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  23.12 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0295  hypothetical protein  30.12 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.630234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  22.9 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  27.05 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.17 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4923  Fe-S oxidoreductase-like protein  29.9 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0114822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2374  putative ferredoxin  23.96 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.790506  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2673  putative ferredoxin  24.39 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0812  hypothetical protein  31.46 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0290283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4547  Fe-S oxidoreductase-like  28.57 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.975746  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5542  Fe-S oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3816  Fe-S oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3708  Fe-S oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3719  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.55 
 
 		 445 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.320551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>