65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8555 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8555  CitB domain protein  100 
 
 		 398 aa  814    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.388597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4212  putative citrate utilization protein B (citB)  68.23 
 
 		 372 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2275  CitB domain-containing protein  65.75 
 
 		 365 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2723  CitB domain-containing protein  54.86 
 
 		 372 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2503  putative ferredoxin  52.23 
 
 		 404 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6133  CitB domain-containing protein  49.46 
 
 		 368 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3134  CitB domain protein  49.87 
 
 		 408 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.870392  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6302  CitB domain-containing protein  50.96 
 
 		 400 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5879  CitB domain-containing protein  49.17 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5625  CitB domain protein  49.18 
 
 		 404 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  53.07 
 
 		 403 aa  332  8e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4211  Citrate utilization protein B  50.14 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6016  CitB domain-containing protein  50.55 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.66746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4071  CitB domain-containing protein  46.81 
 
 		 408 aa  327  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3416  CitB domain protein  46.54 
 
 		 408 aa  326  5e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3489  citrate utilization protein B  49.59 
 
 		 388 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0793  CitB domain-containing protein  46.77 
 
 		 403 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3814  CitB domain-containing protein  50 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0749  citrate utilization protein B  49.44 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.762495 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0797  citrate utilization protein B  49.44 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0737  citrate utilization protein B  49.44 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580161  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0846  citrate utilization protein B  49.3 
 
 		 379 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0810  citrate utilization protein B  49.44 
 
 		 379 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.972731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2087  CitB domain-containing protein  47.95 
 
 		 389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0934488  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3857  CitB domain-containing protein  47.75 
 
 		 377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000315554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0640  citrate utilization protein B  51.77 
 
 		 395 aa  306  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3552  CitB domain-containing protein  41.89 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2382  CitB domain protein  43.8 
 
 		 378 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2322  citrate utilization protein B  43.85 
 
 		 376 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2987  hypothetical protein  45.76 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1892  citrate utilization protein B  44.41 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.494216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0620  citrate utilization protein B  41.92 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3176  citrate utilization protein B  43.11 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  25.19 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  23.77 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  23.65 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  23.75 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  23.35 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  22.86 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.21 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3715  putative ferredoxin  27.47 
 
 		 449 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0539693  normal  0.153427 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0295  hypothetical protein  30.49 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.630234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.19 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2374  putative ferredoxin  26.04 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.790506  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4923  Fe-S oxidoreductase-like protein  28.26 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0114822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2673  putative ferredoxin  27.38 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4547  Fe-S oxidoreductase-like  28.85 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.975746  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3816  Fe-S oxidoreductase-like protein  28.85 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3708  Fe-S oxidoreductase-like protein  28.85 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3719  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.88 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.320551 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1846  putative ferredoxin  27.38 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000698817  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2097  putative ferredoxin  23.86 
 
 		 449 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2280  Fe-S oxidoreductase-like  27.17 
 
 		 445 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  23.34 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1107  putative ferredoxin  29.63 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0158261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0419  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.37 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0271  hypothetical protein  28.12 
 
 		 281 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000339936  hitchhiker  0.000000215213 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5542  Fe-S oxidoreductase-like protein  26.92 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0836  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.26 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000205692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3639  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.37 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0539  hypothetical protein  25 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835661  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  25.19 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4115  Fe-S oxidoreductase-like protein  24.14 
 
 		 445 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  21.96 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>