More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3719 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1646  hypothetical protein  80.9 
 
 
445 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0269  hypothetical protein  80.9 
 
 
445 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4923  Fe-S oxidoreductase-like protein  90.34 
 
 
445 aa  823    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0114822 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3708  Fe-S oxidoreductase-like protein  94.16 
 
 
445 aa  851    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0922  putative ferredoxin  80.67 
 
 
445 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2490  hypothetical protein  80.9 
 
 
445 aa  732    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2280  Fe-S oxidoreductase-like  95.28 
 
 
445 aa  879    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0539  hypothetical protein  80.45 
 
 
445 aa  750    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835661  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4115  Fe-S oxidoreductase-like protein  79.33 
 
 
445 aa  748    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0301  hypothetical protein  80.9 
 
 
445 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2628  hypothetical protein  80.45 
 
 
445 aa  729    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4547  Fe-S oxidoreductase-like  94.16 
 
 
445 aa  851    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.975746  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5542  Fe-S oxidoreductase-like protein  98.65 
 
 
445 aa  905    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3816  Fe-S oxidoreductase-like protein  94.16 
 
 
445 aa  851    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3719  Fe-S oxidoreductase-like protein  100 
 
 
445 aa  917    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.320551 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1449  hypothetical protein  80.67 
 
 
445 aa  719    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2673  putative ferredoxin  64.24 
 
 
454 aa  625  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2097  putative ferredoxin  62.36 
 
 
449 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3715  putative ferredoxin  61.35 
 
 
449 aa  598  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0539693  normal  0.153427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1846  putative ferredoxin  61.35 
 
 
443 aa  590  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000698817  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1107  putative ferredoxin  61.57 
 
 
442 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0158261  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2374  putative ferredoxin  57.78 
 
 
466 aa  552  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.790506  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0419  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  53.93 
 
 
450 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0836  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.58 
 
 
447 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000205692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3639  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  43.65 
 
 
456 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820206 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.64 
 
 
429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0813  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.94 
 
 
455 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0766  hypothetical protein  34.71 
 
 
455 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0817  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.94 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0812  hypothetical protein  34.64 
 
 
454 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0290283 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0295  hypothetical protein  28.9 
 
 
399 aa  176  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.630234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4113  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 
416 aa  170  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  0.0186832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3301  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  32.34 
 
 
415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.47 
 
 
395 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0069  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.21 
 
 
409 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2842  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.18 
 
 
396 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000733482  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2807  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.32 
 
 
396 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.632443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.8 
 
 
399 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0158986 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1125  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.82 
 
 
499 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0229  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.28 
 
 
415 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0567  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.28 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3989  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.28 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.379671  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2422  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.18 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0250  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.19 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149174  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2526  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.18 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.18 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444575  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2471  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.91 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.496093  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.51 
 
 
396 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.72 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02169  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), small subunit  27.51 
 
 
396 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2625  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.51 
 
 
396 aa  127  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2384  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.51 
 
 
396 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02128  hypothetical protein  27.51 
 
 
396 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1416  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  27.51 
 
 
396 aa  127  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3380  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.51 
 
 
396 aa  127  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1408  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.51 
 
 
396 aa  127  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2630  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.18 
 
 
396 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.484622 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2541  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.51 
 
 
396 aa  126  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4561  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.82 
 
 
453 aa  126  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4146  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.15 
 
 
403 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.12 
 
 
423 aa  125  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3955  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.59 
 
 
403 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1519  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.61 
 
 
409 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.717289  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.18 
 
 
424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0048  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), K-small subunit  25 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.923386  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0931  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  25.85 
 
 
478 aa  113  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2960  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  24.59 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0688  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.48 
 
 
413 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1606  putative Fe-S oxidoreductase  24.84 
 
 
470 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.822852  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  22.78 
 
 
459 aa  107  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2518  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  24.77 
 
 
461 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  26.46 
 
 
973 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0866  FAD linked oxidase domain protein  25.72 
 
 
1020 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1019  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.44 
 
 
400 aa  96.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  27.62 
 
 
952 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.84 
 
 
962 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.24 
 
 
434 aa  87.8  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.9 
 
 
722 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 
978 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.87 
 
 
1034 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.76 
 
 
976 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0385  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.99 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.94 
 
 
971 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1616  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  23.92 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1071  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  24.15 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0798  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  23.76 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.417746  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.29 
 
 
989 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.51 
 
 
1035 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1009  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  23.7 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  24.25 
 
 
1024 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  23.7 
 
 
1055 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  24.57 
 
 
1032 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3879  protein of unknown function DUF162  24.2 
 
 
741 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0271364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2766  Fe-S oxidoreductase  24.81 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000181716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  24.83 
 
 
730 aa  73.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  23.84 
 
 
975 aa  73.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0287  ferredoxin, 4Fe-4S  26.24 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  21.76 
 
 
984 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0607  hypothetical protein  27.53 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.682532  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  24.25 
 
 
1070 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>