66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4212 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4212  putative citrate utilization protein B (citB)  100 
 
 		 372 aa  754    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8555  CitB domain protein  68.23 
 
 		 398 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.388597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2275  CitB domain-containing protein  66.02 
 
 		 365 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2723  CitB domain-containing protein  52.99 
 
 		 372 aa  359  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6302  CitB domain-containing protein  49.72 
 
 		 400 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2503  putative ferredoxin  50.68 
 
 		 404 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5625  CitB domain protein  48.4 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3134  CitB domain protein  48.79 
 
 		 408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.870392  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6133  CitB domain-containing protein  48.51 
 
 		 368 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  53.78 
 
 		 403 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5879  CitB domain-containing protein  48.89 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4071  CitB domain-containing protein  47.96 
 
 		 408 aa  331  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3416  CitB domain protein  47.68 
 
 		 408 aa  331  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6016  CitB domain-containing protein  50.41 
 
 		 404 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.66746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4211  Citrate utilization protein B  48.48 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0846  citrate utilization protein B  47.96 
 
 		 379 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0749  citrate utilization protein B  48.09 
 
 		 379 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.762495 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0737  citrate utilization protein B  48.09 
 
 		 379 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0797  citrate utilization protein B  48.09 
 
 		 379 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0810  citrate utilization protein B  48.09 
 
 		 379 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.972731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2087  CitB domain-containing protein  47.95 
 
 		 389 aa  316  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0934488  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3857  CitB domain-containing protein  47.89 
 
 		 377 aa  311  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000315554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0793  CitB domain-containing protein  45.58 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3814  CitB domain-containing protein  48.2 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3489  citrate utilization protein B  49.04 
 
 		 388 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0640  citrate utilization protein B  49.59 
 
 		 395 aa  299  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3552  CitB domain-containing protein  43.05 
 
 		 370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2322  citrate utilization protein B  42.54 
 
 		 376 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2382  CitB domain protein  40.92 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2987  hypothetical protein  45.51 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1892  citrate utilization protein B  44.29 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.494216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0620  citrate utilization protein B  43.49 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3176  citrate utilization protein B  43.23 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  24.11 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  23.69 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  24.53 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  25.46 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  22.76 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0295  hypothetical protein  37.04 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.630234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3715  putative ferredoxin  32.22 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0539693  normal  0.153427 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.33 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.19 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2374  putative ferredoxin  28.89 
 
 		 466 aa  53.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.790506  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4923  Fe-S oxidoreductase-like protein  31.91 
 
 		 445 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0114822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  22.16 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.86 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  22.34 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4547  Fe-S oxidoreductase-like  29.25 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.975746  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3708  Fe-S oxidoreductase-like protein  29.25 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3816  Fe-S oxidoreductase-like protein  29.25 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0836  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.42 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000205692  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0419  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 		 450 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1107  putative ferredoxin  29.07 
 
 		 442 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0158261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3719  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.36 
 
 		 445 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.320551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2097  putative ferredoxin  26.67 
 
 		 449 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4115  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.17 
 
 		 445 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2673  putative ferredoxin  28.92 
 
 		 454 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  21.98 
 
 		 384 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3639  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  30.95 
 
 		 456 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2280  Fe-S oxidoreductase-like  26.6 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0539  hypothetical protein  27.59 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835661  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1846  putative ferredoxin  27.71 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000698817  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5542  Fe-S oxidoreductase-like protein  26.42 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0812  hypothetical protein  26.89 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0290283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0813  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.35 
 
 		 455 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  22.02 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>